보스니아 전쟁 초기에 크로아티아 방위평의회는 보스니아 헤르체고비나 공화국군(ARBiH)과 함께 보스니아 세르비아군에 대항하여 싸웠으나, 분쟁 후반에는 보스니아 헤르체고비나 공화국군과 모스타르 지역에서 충돌하였다.[1] 유럽 공동체 감시 임무(ECMM)는 1993년 초 크로아티아 방위평의회의 병력을 45,000~55,000명으로 추정하였다.[2] 1993년 7월 CIA는 크로아티아 방위평의회의 병력을 40,000~50,000명으로 추정하였다.[3] 이전에 보스니아에서 활동하던 크로아티아 권리당을 모체로 하는 군사 조직 크로아티아 방위군을 비롯한 다른 크로아티아인 무장 조직들은 서서히 해체되어 크로아티아 방위평의회에 합류했다.[4][5]
1995년 12월 크로아티아 방위평의회는 명목상 보스니아 헤르체고비나군과 합병하였지만, 2005년 스릅스카 공화국군이 보스니아군에 합류할 때까지 편제를 유지하였다.
.svg){kind=small}
.svg){kind=small}
