시계외 요금은 성인 기준으로 9번, 9-1번에 한하여 속초 시계를 넘는 구간부터 1km당 138원이 가산되어 양양-속초 구간 탑승시 3230원이 부과된다. 과거에는 고성구간을 운행하던 1번, 1-1번에도 시계외 요금이 적용되었으나. 2022년 1월 1일 부터 시계외 요금이 폐지 되었다.
강원도 시 단위중 유일하게 무료환승할인이 불가능하였으나 2017년 8월 1일부터 속초 시내 노선을 경유하는 버스 한정으로 무료환승제도를 시행하게 되었다. 다만 고성군과 양양군간의 협의가 이루어지지 못한 관계로 속초 ↔ 고성, 속초 ↔ 양양을 오가는 일부 시내버스(시계외 요금적용 버스)는 환승제도를 적용하지 않는다.[3]
환승 할인
2017년 8월부터 속초시 차적 및 속초시 시내를 경유하는 버스에 한정하여 환승이 가능하다. 환승시간은 90분이며 1일 1회 가능하다. 동일번호 노선버스와는 환승이 되지 않는다. 고성군, 양양군과의 협의를 못한 관계로 속초 ↔ 고성군 운행버스(1, 1-1, 13, 13-1. 13-2, 15, 16, 18, 19, 22번 등)와 속초 ↔ 양양군 운행버스(9, 9-1번) 및 시계외구간 요금적용 버스는 환승할인이 불가하다. 다만 고성군 토성면 원암리(미시령 구간)를 운행하는 3-1번 버스(속초 ↔ 고성군 토성면 원암리, 델피노리조트)는 3번 버스를 포함한 속초시내버스와 환승할인이 적용된다. 그러나 1번, 1-1번, 1-2번, 13번, 15번, 16번, 18번, 19번 등 같은 고성군 토성면을 경유하는 버스와는 속초시내에서도 환승할인이 불가하다.
동해상사 차고지 구분
동해상사 버스의 경우 속초시내에 대포동 차고지와 장사동 차고지 두 곳이 있으며 대포동 차고지는 속초 ↔ 고성군을 오가는 버스들이, 장사동 차고지는 속초 시내만을 경유하는 버스들이 소속되어있다. 장사동 차고지 소속 중 3-1번 버스는 유일하게 고성군 원암리를 경유하는 버스로 동해상사 장사동 차고지 버스 중 유일한 시계외구간요금 적용버스(고성군 원암리, 일성콘도, 델피노리조트)이다. 동해상사 대포동 차고지 소속버스들은 속초 ↔ 고성군을 오가는 버스가 많으므로 장사동 차고지 소속 버스와는 다르게 환승할인이 불가하다. 또한 장사동 차고지 소속의 7번, 7-1번 버스는 설악산을 경유하기 때문에 동해상사 대포동 차고지를 통과하며 1번, 1-1번, 13번 등의 대포동 및 고성군 마차진리 차고지 소속 버스는 장사동 차고지를 통과한다.