속씨식물 계통분류 그룹(AGP II)에 의하면, 이 두 과는 목으로 따로 분류되지 않지만 진정장미군 I에 포함된다. 비록 유일한 속을 가진 크라메리아과가 남가새과와 일부 공통의 특징을 공유하고 있음에도 불구하고, 연구자들은 별도의 과로 이들을 유지하는 것이 낫다고 본다. (예를 들면 쉐한(Sheahan)과 체이스(Chase)). 남가새목이라는 이름은 이 2개의 과를 묶는 데 사용될 수도 있다. 크론퀴스트 분류 체계에서, 남가새과는 무환자나무목에 포함되어 있었고, 크라메리아과는 원지목에 속해 있었다.