Nella stagione del debutto con gli Addicks, ha segnato cinque reti, compresa quella ai danni dell'Arsenal. Il 30 dicembre 2006, El Karkouri è stato ammonito per simulazione dall'arbitro Rob Styles in una sfida contro l'Aston Villa, durante un'azione che ha coinvolto il difensore svedeseOlof Mellberg, all'epoca Villan. Il 9 aprile 2007, nella sfida contro il Reading, è stato accusato nuovamente di simulazione, quando Leroy Lita lo ha colpito con una testata.
Il tecnico del Reading, Steve Coppell, ha accusato El Karkouri di aver esagerato e amplificato il contatto.[2] Lita ha chiesto alla FA di fare qualcosa contro questo tipo di gesti e ha dichiarato di non aver neppure colpito il difensore marocchino.[3] La FA ha però squalificato Lita per tre giornate, per condotta violenta. Coppell, in merito, non ha aggiunto altro.
Il 10 giugno 2007, ha firmato un contratto biennale per il Qatar SC.[4] A novembre 2008, sono stati resi noti dei problemi con il tecnico che hanno messo in dubbio la permanenza del difensore.[5]
Nell'agosto 2011 è passato all'Umm-Salal, ma a causa di un infortunio non ha disputato alcuna partita con il club qatariota; il 25 maggio 2012 ha annunciato il ritiro dal calcio giocato.[6][7]