Il campionato di Serie A2 2008-2009 è stata la 11ª edizione della categoria. La stagione regolare ha preso avvio il 20 settembre 2008 e si è conclusa il 18 aprile 2009, prolungandosi fino al 6 giugno 2009 con la disputa delle partite di spareggio.
La fusione tra la neopromossa Azzurra Sant'Alfonso e il Marigliano a formare l'Azzurra Marigliano, la mancata iscrizione del Perugia e il ripescaggio di Polizia Penitenziaria in Serie A comportano il ripescaggio di Atletico Teramo e Regalbuto, finaliste play-off della precedente Serie B nonché, per il secondo anno di seguito, del Giovinazzo[1]. Il Cadoneghe confluisce nel neonato "Sporting Marca", il Dese cambia la propria denominazione in "Venezia Calcio a 5" e l'ATS Città di Quartu in "Atiesse Calcio a 5". Le regioni più rappresentate in questa edizione sono il Lazio, la Puglia e il Veneto con quattro formazioni ciascuna, seguite da Campania e Sardegna con tre. Le formazioni provenienti da Abruzzo ed Emilia-Romagna sono due a testa, mentre Piemonte, Toscana e Umbria si fermano a una.
Si qualificano al turno successivo le squadre che, al termine delle due gare, avranno ottenuto il maggior punteggio o, a parità di punteggio, quelle che avranno realizzato il maggior numero di reti. In caso di ulteriore parità saranno disputati due tempi supplementari da 5' ciascuno, al termine dei quali, se perdurasse ancora la parità, sarà ritenuta vincente la squadra con la migliore posizione in classifica al termine della stagione regolare.
Dal 5 maggio al 16 maggio 2009
Dal 28 aprile al 9 maggio 2009
Gruppo Fassina e Torrino qualificati ai play-out di serie A 2008-2009.
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