Trufant fu scelto dai Seattle Seahawks come 11º scelta assoluta del draft 2003[1]. Il suo impatto nella NFL fu subito notevole, con molti quarterback che evitavano di lanciare nella sua area di copertura. Proveniente da Tacoma e laureato alla Washington State University, Trufant era considerato un idolo cittadino. Nel 2007 giocò un ruolo importante nella difesa dei Seahawks, con un record in carriera di 7 intercetti, di cui uno ritornato in un touchdown da 84 yard. Inoltre deviò 15 passaggi e mise a segno 85 tackle, venendo selezionato per il Pro Bowl del 2008 alle Hawaii. Il 21 febbraio 2008 i Seahawks applicarono su di lui la franchise tag, prolungandogli il contratto di un anno con un accordo del valore di 9,465 milioni di dollari.
Il 26 marzo 2008 i Seahawks fecero firmare a Trufant un nuovo contratto di 6 anni, del valore di 50,2 milioni di dollari, compreso un bonus di 10 milioni alla firma[2].
Il 1º aprile 2010, Marcus Trufant viaggiò alla Cambridge Elementary School a Surrey, Columbia Britannica, Canada in quanto uno degli studenti di tale istituto, Tyler Wedel, fu uno dei quattro canadesi vincitori del concorso della NFL Take A Player To School (porta un giocatore a scuola) ed il vincitore Wedel scelse Trufant per parlare agli studenti della sua carriera e della esperienza nella NFL[3].
La stagione 2011 di Trufant terminò già il 17 ottobre a causa di un infortunio e fu messo in lista infortunati.
Il 7 marzo 2012, Trufant fu svincolato dai Seahawks[4] ma il 9 aprile firmò un nuovo contratto annuale[5].
Il 5 maggio 2012, Trufant fu inserito nella Pacific Northwest Football Hall of Fame[6]. Nella stagione 2012l l'ultima a Seattle, disputò 12 partite, 2 delle quali come titolare, mettendo a segno 34 tackle e forzando un fumble.
Jacksonville Jaguars
Il 7 maggio 2013, Trufant firmò coi Jacksonville Jaguars, ritrovando il suo ex coordinatore difensivo Gus Bradley, nel frattempo divenuto capo-allenatore dei Jaguars[7]. Il 31 agosto 2013 fu svincolato[8].
Il 24 aprile 2014, Trufant firmò un contratto di un giorno con Seattle per ritirarsi come Seahawk[9].
^(EN) 2003 National Football League Draft, Pro Football Hall of Fame. URL consultato il 23 settembre 2012 (archiviato dall'url originale il 29 settembre 2015).