Il campionato italiano di calcio di Eccellenza regionale 2002-2003 è stato il dodicesimo organizzato in Italia. Rappresenta il sesto livello del calcio italiano.
Questi sono i gironi organizzati dal comitato regionale della regione Emilia-Romagna.
^Alla fine della stagione acquista il titolo sportivo di Serie D del Mezzolara. Ufficialmente l'A.C. Mezzolara si trasferisce a Cento e assume la denominazione di A.C. Centese, mentre il F.C. Centese 1913 si trasferisce a Budrio e assume quella di A.C. Emme A.S.D. (vedi comunicato FIGCArchiviato il 4 marzo 2016 in Internet Archive.)