Nella stagione 2000-2001 il Catania disputa il girone B del campionato di Serie C1, raccoglie 58 punti con il terzo posto in classifica. Sale diretto in Serie B il Palermo, la squadra etnea disputa i playoff, supera l'Avellino nella semifinale, ma perde la doppia finale con il Messina. La prima stagione del nuovo secolo per il Catania è stata una stagione dai due volti, quello brutto nel girone di andata, chiuso al dodicesimo posto con 21 punti, ed il volto bello nel girone di ritorno, caratterizzato da una rimonta incredibile, con 37 punti raccolti e la Serie B, prima accarezzata e sfiorata, ma poi persa nella finale dei playoff. A gennaio sono arrivati alcuni rinforzi, che hanno cambiato il volto della squadra etnea, dal Crotone è giunto il bomber Alessandro Ambrosi, capelli lunghi e pizzetto da profeta del gol, "Re Leone" ne ha segnati 12 in 20 partite, playoff compresi, recando ossigeno alla rimonta.
Due allenatori si sono alternati alla guida del Catania in questa stagione, Ivo Iaconi e Vincenzo Guerini. Mentre il Catania inizia la parte più interessante del campionato, all'alba del 2001 si spegne Gianni Mineo, segretario "factotum" per un trentennio del Catania. Nella Coppa Italia Serie C i rossoazzurri vincono il girone Q di qualificazione, poi nei sedicesimi superano l'Acireale, negli ottavi hanno la meglio sul Palermo, nei quarti sono eliminati dal torneo dal Brescello, ai calci di rigore.