Sako ha iniziato la propria carriera nel Châteauroux, nella stagione 2005-2006 della Ligue 2 subentrando a fine partita contro il Bastia (partita vinta per 4-1). Precedentemente aveva militato per cinque anni nelle giovanili della squadra. Il 9 luglio 2009 è passato al Saint-Étienne, con cui ha firmato un contratto quadriennale[2].
Nazionale
Bakary Sako ha disputato una partita con il Mali Under-17 nel 2005. Nel 2009 ha giocato con l'Under-21 francese e ha segnato contro il Qatar il suo primo gol.
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