2009. június 18-án kétéves szerződést kötött a katari al-Garáfa együttesével, annak ellenére, hogy többek között a Genoa és az Internazionale is szívesen látta volna soraiban. A Lyon – figyelembe véve a nyolcéves szolgálatot, amit a klubnak tett –, ingyen engedte elszerződni. Sokak szerint a klub legjobb játékosa volt.
Pályafutása
Brazília
Juninho 1993-ban és 1994-ben a Sport Recife csapatában játszott, majd 1995 és 2001 között a rio de janeiro-i Vasco da Gama játékosa volt, mielőtt a Lyon szerződtette. A Vasco da Gama-nál több trófeát is begyűjtött, többek közt a brazil bajnoki címet 1997-ben és 2000-ben, valamint 2000-ben megkapta a brazil Ezüstlabdát is, mint a szezon legjobb brazil középpályása.
Juninho lett 1999. szeptember 7-én az első játékos, aki két mérkőzésen játszott két különböző országban ugyanazon a napon. Porto Alegre városában lépett pályára a válogatottban az Argentína elleni barátságos mérkőzés második félidejében, amit Brazília 4–2-re nyert meg. Még időben érkezett Uruguay-ba, hogy játsszon a második félidőben egy Mercosur-kupa mérkőzésen a Nacional ellen.
Franciaország
2001-ben hagyta el Brazíliát és csatlakozott a francia Lyonhoz. Érkezése előtt a csapat soha nem nyert francia bajnokságot, viszont első szezonjában bajnoki címet nyertek, és ezt még hat szezonban ismételték meg egymás után. A Lyon edzője, Gérard Houllier kinevezte csapatkapitánynak.
A válogatottban
1999-ben mutatkozott be a brazil válogatottban. A 37-szeres válogatott játékosként tagja volt a 2006-os világbajnokságon részt vevő brazil csapatnak. Carlos Alberto Parreira szövetségi kapitány három mérkőzésen szavazott neki bizalmat, a japánok ellen végig pályán volt, s egy gólt lőtt. Ghána ellen csereként jött be, míg Franciaország ellen lecserélték. A világbajnokságon összesen 183 percet játszott. A torna után (Brazília a negyeddöntőben búcsúzott) lemondta a válogatottságot.
Szabadrúgásai
Juninho-t a világ legjobb szabadrúgást elvégző játékosai közt tartják számon.[2]2008. május 7-ig 37 gólt szerzett szabadrúgásból a Lyonban.[3] A Lyon előtt is megmutatkozott a tehetsége, a Vascóban több szabadrúgásgólt is szerzett.[4]