Le , le président de l'Assemblée nationale du Burkina Faso, Salif Diallo est élu à la tête MPP. Il meurt en et est remplacé par intérim par Simon Compaoré. Ce dernier est élu président du parti en [6].
Le , Alassane Bala Sakandé est élu président du MPP à issue d'un congrès extraordinaire et remplace Simon Compaoré à la présidence du parti. Compaoré est nommé président d'honneur du parti[7]. Clément Sawadogo est premier vice-président du parti[8].
En , un coup d'État militaire renverse le président Kaboré. La junte au pouvoir (le Mouvement patriotique pour la sauvegarde et la restauration dirigé par Paul-Henri Sandaogo Damiba) gouverne sans les partis politiques. En , de nombreux membres influents du parti le quittent (en particulier 46 membres du bureau national). Ces défections sont analysées comme une volonté de ne plus être associé à l'histoire et à l'échec du MPP quand il était au pouvoir[9].