Jacques Gauthier (Jacques Armand Gauthier) est un paléontologue des vertébrés, spécialiste de la systémique et un des promoteurs de l'utilisation de la cladistique en paléontologie.
Il continua dans cette voie avec un article important sur le fait que les oiseaux étaient issus des théropodes. C'était la première analyse cladistique détaillée des dinosaures théropodes. Elle fut à l'origine d'une révolution dans la Classification phylogénétique des dinosaures qui vit la cladistique remplacer le système de Carl von Linné dans la classification des espèces et une compréhension de la phylogénie des dinosaures. Les travaux de Gauthier en 1984 et 1986 font encore référence dans l'analyse cladistique moderne des diapsides et des dinosauriens.
L'ensemble des références sont en langue anglaise.
Gauthier, J., 1984. A cladistic analysis of the higher systematic categories of the Diapsida. [dissertation]. Available from University Microfilms International, Ann Arbor, #85-12825, vii + 564 pp.
Gauthier, J., 1986. « Saurischian monophyly and the origin of birds ». In: K. Padian, ed. The Origin of Birds and the Evolution of Flight. Memoirs California Academy of Sciences 8. pp. 1–55
Gauthier, J.; Estes, R.; et de Queiroz, K. (1988). « A phylogenetic analysis of Lepidosauromorpha ». In: R. Estes and G. Pregill, eds. The Phylogenetic Relationships of the Lizard Families. Stanford University Press, Palo Alto. pp. 15–98.
Gauthier, J.; Kluge, A.; et Rowe, T. (1988). « Amniote phylogeny and the importance of fossils » in Cladistics 4(2):105–209.
Rowe, T.; et Gauthier, J. (1990). « Ceratosauria ». In: D. Weishample, P. Dodson et H. Osmolska, eds., The Dinosauria. University of California Press, Berkeley. pp. 151–168.
de Queiroz, K. et Gauthier, J. (1992). « Phylogenetic taxonomy ». in Annual Review of Ecology and Systematics 23:449–480.
Gauthier, J. A. (1994). « The diversification of the amniotes ». In: D. Prothero, ed. Major Features of Vertebrate Evolution: Short Courses in Paleontology. Paleontological Society. pp. 129–159
Donoghue, M. J.; et Gauthier, J. A. (2004) « Implementing the PhyloCode ». Trends in Ecology & Evolution 19(6):281–282.
↑(en) K. de Queiroz et J. Gauthier, « Phylogeny as a central principle in taxonomy: Phylogenetic definitions of taxon names », Syst. Zool, vol. 39, , p. 307–322.
↑(en) K. de Queiroz et J. Gauthier, « Phylogenetic taxonomy », Annu. Rev. Ecol. Syst., vol. 23, , p. 449–480.
↑(en) K. de Queiroz et J. Gauthier, « Toward a phylogenetic system of biological nomenclature », Trends Ecol. Evol., vol. 9, , p. 27–31.