En 2017, le diocèse de Sainte-Anne-de-la-Pocatière comprend une population de 88 440 catholiques, soit plus de 95% de la population totale du territoire, desservie par un total de 56 prêtres et sept diacres permanents[4]. La même année, les neuf unités pastorales existantes ont été abolies et remplacées par trois grandes « unités missionnaires », l'Ouest, le Centre et l'Est, qui rassemblent les 55 paroisses du diocèse[1],[4],[6],[7]. En 2021, le diocèse comprend 60 églises[1].
L'unité missionnaire Centre comprend les 22 paroisses suivantes : Notre-Dame de Bonsecours, Notre-Dame-de-Liesse, Notre-Dame-du-Mont-Carmel, Saint-André, Sainte-Anne, Saint-Aubert, Saint-Bruno, Saint-Cyrille, Saint-Damase, Saint-Denis-de-la-Bouteillerie, Saint-Eugène, Saint-Gabriel-Lallemant, , Sainte-Hélène, Saint-Jean-Port-Joli, Saint-Joseph-de-Kamouraska, Saint-Louis-de-Kamouraska, Sainte-Louise, Saint-Onésime, Saint-Pacôme, Saint-Pascal de Kamouraska, Saint-Philippe-de-Néri et Saint-Roch-des-Aulnaies[12]. La paroisse de Saint-Germain est dissoute et ajouter à Saint-Pascal.
L'unité missionnaire Est comprend les 10 paroisses suivantes : Marie-Médiatrice d’Estcourt, Notre-Dame-du-Portage, Saint-Alexandre, Saint-Antonin, Saint-Athanase, Saint-David, Saint-Éleuthère, Saint-Joseph, Saint-Marc et Saint-Patrice[13].