Brian Alainu'uese est scolarisé avec le Wesley College d'Auckland, et joue au rugby avec l'équipe de l'établissement[4]. Par la suite, il joue avec le club de l'University of Waikato Rugby Club dans le championnat amateur de la région de Waikato[4].
Ses performances en club lui permettent d'être retenu dans l'effectif de la province de Waikato pour la saison 2013 de NPC (championnat des provinces néo-zélandaises)[5]. Il joue sa première rencontre avec cette équipe le contre Northland[2]. Il joue un total de huit rencontres lors de cette première saison[1]. La même année, il joue également avec l'équipe Development (espoir) des Chiefs[6].
En 2015, alors qu'il joue toujours avec l'équipe Development des Chiefs, il appelé à jouer en équipe première après une cascade de blessure[7],[8]. Il fait ses débuts en Super Rugby le contre les Bulls[9]. Il dispute deux rencontres lors de la saison[2].
À cause de blessures, il manque ensuite l'intégralité des saisons 2014 et 2015 de NPC, avant de faire son retour avec Waikato en 2016[10].
En , alors qu'il manque de temps de jeu à Glasgow, il demande à être libéré de son contrat afin de rejoindre le RC Toulon en Top 14 pour un contrat d'une saison, plus une autre en option[13]. Peu après son arrivée, il prolonge son contrat pour deux autres saisons, soit jusqu'en juin 2021[14]. Il s'impose rapidement comme un cadre au poste de deuxième ligne, grâce à sa puissance et ses qualités de combattant[15]. En 2021, il se réengage jusqu'en 2023 puis, l'année suivante, prolonge une nouvelle fois, portant son engagement avec le club varois jusqu'en 2025[16],[17].
Il est sélectionné pour la première fois avec l'équipe des Samoa en afin de participer à la tournée d'automne en Europe[18]. Il obtient sa première sélection le face à l'Italie à Padoue[19].
En , il est retenu dans le groupe samoan de 40 joueurs sélectionné pour préparer la Coupe du monde 2023[20]. Le , il est annoncé au sein du groupe définitif pour participer au Mondial en France[21]. Il joue trois matchs lors de la compétition, dont deux en tant que titulaire[3].