Yamato on paikannimenä uudehko. Japanin kunnallishallinnon perustamisen yhteydessä vuonna 1889 nykyisen kaupungin alue jakautui Shibuyan ja Tsurumin kyläkuntiin, joista jälkimmäinen muutti nimensä Yamatoksi vuonna 1891. Yamatosta tehtiin maaseutukaupunki vuonna 1943, Shibuyasta vuonna 1944. Osa Shibuyasta liitettiin vuonna 1955 Fujisawan kaupunkiin, jäljelle jäänyt osa seuraavana vuonna Yamatoon, josta tehtiin kaupunki vuonna 1959.[4] Yamatoa palvelevat Tokyū-rautateidenDen’entoshi-linja, Odakyū-rautateidenEnoshima-linja ja Sagami-rautateidenSōtetsu-päälinja.[1]