Ο θεσμός του κυπέλλου, αποτελεί ταυτόχρονα την πρώτη φάση του Κυπέλλου Ερασιτεχνών της ΕΠΟ. Η ομάδα που ανακηρύσσεται κυπελλούχος ΕΠΣ Έβρου, αποκτά το δικαίωμα συμμετοχής στο Κύπελλο Ερασιτεχνών.[1]
Για την περίοδο 2015–16, η δομή του πρωταθλήματος της Ε.Π.Σ. Έβρου είναι η εξής:[2][3]
Α΄ Κατηγορία
Β΄ Κατηγορία
Α΄ Όμιλος
Β΄ Όμιλος
Γ΄ Όμιλος
Α΄ Κατηγορία
Με τη συμμετοχή 11 συλλόγων διεξάγεται η Α΄ Κατηγορία, αντί για 14 όπως είχε αρχικά σχεδιαστεί, καθώς Ο.Φ. Ισαακίου και Α.Ο. Νεοχωρίου επέλεξαν να δηλώσουν συμμετοχή στη Β΄ Κατηγορία και η Α.Ο. Καππαδοκών αποχώρησε[4] και δε συμμετείχε σε καμία διοργάνωση. Η Α.Ε. Διδυμοτείχου κατέκτησε τον τίτλο . Οι 3 τελευταίες ομάδες υποβιβάζονται με πιθανότητες να έχουμε υποβιβασμό 5 ομάδων αν οι 2 σύλλογοι του Έβρου που αγωνίζονται στη Γ΄ Εθνική (Εθνικός Αλεξανδρούπολης , Έβρος Σουφλίου) επιστρέψουν στο τοπικό πρωτάθλημα.[5]
↑Από συνένωση των συλλόγων Αναγέννηση Μεταξάδων και Θύελλα Παλιουρίου που κράτησε μόνο για την περίοδο 2015-16[6]
Β΄ Κατηγορία
Η Β΄ Κατηγορία διεξάγεται με τη συμμετοχή 35 συνολικά ομάδων σε τρείς ομίλους των 12 ή 11 ομάδων ο καθένας. Στην κλήρωση συμμετείχαν 38 σύλλογοι αλλά Α.Μ.Ο. Αμπελακίων , Άρης Πραγγίου και Α.Ε. Καρωτής αποχώρησαν πριν την έναρξη του πρωταθλήματος. Κατά τη διάρκεια του πρωταθλήματος είχαμε αποχωρήσεις άλλων δυο συλλόγων (Α.Σ. Πέπλου και Ο.Φ. Ισαακίου). Οι πρωταθλήτριες κάθε ομίλου κερδίζουν την άνοδο στην Α' Κατηγορία, όμως και οι τρεις πρωταθλήτριες των ομίλων τους επέλεξαν να μην αγωνιστούν στην Α΄ κατηγορία αλλά να παραμείνουν στη Β΄ της περιόδου 2016-17. Έτσι την άνοδο πήραν οι δευτεραθλήτριες Θράκη Φερών, Ατρόμητος Ασπρονερίου και Ακρίτας Νέας Βύσσας[7]
Στο θεσμό του κυπέλλου συμμετέχουν τα σωματεία της Ε.Π.Σ. Έβρου. Η διοργάνωση ολοκληρώθηκε στις 24 Φεβρουαρίου του 2016 με τον τελικό. Το κύπελλο κατέκτησε ο Α.Σ. Έβρος Σουφλίου.