Το Πρωτάθλημα της ΕΠΣ Αθηνών την περίοδο 1949-50 διεξήχθη σε τρεις κατηγορίες. Πρωταθλήτρια αναδείχθηκε η ΑΕΚ για τέταρτη και τελευταία φορά στην ιστορία της. Όμως, δεν είχε την ευκαιρία να εκπροσωπήσει την ΕΠΣΑ στο πανελλήνιο πρωτάθλημα, διότι αυτό ματαιώθηκε λόγω υποχρεώσεων της Εθνικής ομάδας. Από τη σεζόν αυτή, έπειτα από απόφαση της ΕΠΟ, στις περιπτώσεις ισοβαθμιών καθιερώθηκαν αγώνες κατάταξης και για τον υποβιβασμό ή την άνοδο μιας ομάδας καθιερώθηκαν διπλοί αγώνες διαβάθμισης ανάμεσα στον τελευταίο της ανώτερης κατηγορίας και τον πρώτο της αμέσως κατώτερης.
Κατηγορίες
Α΄ με δέκα (10) ομάδες σε όμιλο δύο γύρων (18 αγώνες).
Β΄ με είκοσι (20) ομάδες σε ενιαίο όμιλο ενός γύρου (19 αγώνες).
Γ΄ με δεκαέξι (16) ομάδες σε ενιαίο όμιλο ενός γύρου (15 αγώνες).
Δόκιμη κατηγορία: πρώτη φάση σε τρεις ομίλους των οκτώ (8), δέκα (10) και δέκα (10) ομάδων και τελική φάση με έξι ομάδες (3Χ2).
Βαθμολογία Α΄ κατηγορίας
Πρωταθλήτρια αναδείχθηκε η ΑΕΚ, έπειτα από συναρπαστική μάχη με τον Πανιώνιο. Η κατηγορία διασπάστηκε σε Α1 με έξι (6) ομάδες και Α2 με οκτώ (8), έτσι ώστε οι κορυφαίες ομάδες να έχουν χρόνο για να μετέχουν στο πανελλήνιο πρωτάθλημα, αλλά και στα διάφορα τουρνουά (Κύπελλα Χριστουγέννων και Πάσχα). Έτσι στην κατηγορία έμειναν μόνο οι έξι πρώτες ομάδες, ενώ οι υπόλοιπες τέσσερις με τις τέσσερις πρώτες της Β΄ συγκρότησαν την Α2. Ο Απόλλων αναγκάστηκε να δώσει αγώνα διαβάθμισης με τον πρωταθλητή της Β΄ κατηγορίας για να παραμείνει στην Α1.
Σύμφωνα με τον κανονισμό πρωταθλήματος, για την συμμετοχή στην Α1΄ κατηγορία της επόμενης σεζόν έδωσαν αγώνες διαβάθμισης η τελευταία ομάδα της Α1, δηλαδή ο Απόλλων, αφού μόνο έξι ομάδες θα μετείχαν στην Α1, με την πρωταθλήτρια της Β΄, δηλαδή το Αιγάλεω. Επιβλήθηκε ο Απόλλων, ο οποίος διατήρησε τη θέση του στην ανώτερη κατηγορία, ενώ το Αιγάλεω εντάχθηκε στην Α2. Τα αποτελέσματα των δύο αγώνων ήταν:
Συμμετείχαν 20 ομάδες. Διεξήχθη πρωτάθλημα ενός γύρου (19 αγώνες). Πρωταθλητής αναδείχθηκε το Αιγάλεω έπειτα από αγώνα μπαράζ με την ΑΕ Χαλανδρίου. Όμως, δεν ανέβηκε στην Α1 κατηγορία, αφού έχασε στον αγώνα διαβάθμισης από τον Απόλλωνα. Λόγω αναδιάρθρωσης των κατηγοριών, οι τέσσερις πρώτες ομάδες της Β΄ με τις τέσσερις τελευταίες της Α΄ συγκρότησαν την Α2 κατηγορία (8 ομάδες). Την επόμενη σεζόν τη Β΄ κατηγορία (20 ομάδες) συγκρότησαν οι υπόλοιπες 16 και οι τέσσερις (4) πρώτες ομάδες της Γ΄ (Νίκη Πλάκας, Αρίων, Νίκη Αμπελοκήπων και Ηρακλής Αθηνών).
Βαθμολογία
Πρωταθλητής: Αιγάλεω, απέτυχε να ανεβεί στην Α΄ στον αγώνα διαβάθμισης, αλλά εντάχθηκε στην Α2.
3 Πρόκειται για τον "Α.Ο. Δάφνης" και όχι για τον Π.Α.Ο. Αγίου Δημητρίου. Ο Δήμος Δάφνης λεγόταν τότε "Δήμος Αγ. Δημητρίου", από όπου και η ονομασία της ομάδας.
Αγώνας διαβάθμισης
Σύμφωνα με τον κανονισμό πρωταθλήματος, για την συμμετοχή στην Β΄ κατηγορία της επόμενης σεζόν έδωσαν αγώνες διαβάθμισης η τελευταία ομάδα της Β΄ με την πρωταθλήτρια της Γ΄, δηλαδή ο Καλλιθαϊκός με τη Νίκη Πλάκας, στους οποίους επικράτησε η Νίκη και ανέβηκε κατηγορία. Τελικά, λόγω της αναδιάρθρωσης, παρέμεινε και ο Καλλιθαϊκός. Τα αποτελέσματα ήταν:
Συμμετείχαν 17 ομάδες και διεξήχθη πρωτάθλημα ενός γύρου [1](17 αγωνιστικές / 16 αγώνες). Όμως, τρεις ομάδες (Ποσειδών Γλυφάδας, Ιωνικός Αθ. και Κεραμεικός) διέκοψαν στην πορεία και ο ΓΣ Αμαρουσίου συμμετείχε χωρίς να βαθμολογείται, καθώς δεν είχε ολοκληρωθεί η εγγραφή του στην ΕΠΟ.[2] Έτσι στην τελική βαθμολογία παρουσιάζονται μόνο δεκατρείς (13). Πρωταθλήτρια αναδείχθηκε η Νίκη Πλάκας, η οποία έδωσε νικηφόρο αγώνα διαβάθμισης με τον τελευταίο της Β΄ κατηγορίας, Καλλιθαϊκό, και κέρδισε την άνοδό της. Τελικά, λόγω της αναδιάρθρωσης των κατηγοριών, στη Β΄ κατηγορία ανέβηκαν τέσσερις ομάδες.
Βαθμολογία
Πρωταθλήτρια: Νίκη Πλάκας, ανέβηκε στη Β΄ έπειτα από αγώνα διαβάθμισης.
1 Με ένα ματς λιγότερο. 2 Μετονομασία του Αγιελεουσιακού Καλλιθέας, με τον οποίο είχε συγχωνευτεί και το ανεξάρτητο σωματείο "Ένωσις Αγ. Ελεούσης". 3 Εντάχθηκε στην κατηγορία ως συνέχεια της "Μικρασιατικής Αθηνών" (ίδρ. 1926), η οποία αποσύρθηκε την προηγούμενη σεζόν.
Δόκιμη κατηγορία
Στην πρώτη φάση συμμετείχαν 28 ομάδες σε τρεις ομίλους, από τις οποίες στην τελική φάση προκρίθηκαν έξι. Η τελική φάση διεξήχθη σε δύο γύρους (10 αγωνιστικές) και τον τίτλο κατέκτησε αήττητη η ΑΕ Καλλιθέας, η οποία εντάχθηκε στη Γ΄ κατηγορία της ΕΠΣΑ.
Σωματεία (α΄ φάση)
Τα σωματεία που μετείχαν στην α΄ φάση της δόκιμης κατηγορίας ήταν τα εξής ανά όμιλο: