Κάτω από την επίδραση της Πριγκίπισσας του Ουρσέν και του Καρδινάλιου Πορτοκαρρέρο, διορίστηκε Διοικήτρια και Γενική Διαχειρίστρια όταν ο σύζυγός της έπρεπε να μετακομίσει στα σενάρια του πολέμου το 1702.[4] Ενεργούσε υπεύθυνα κατά τη διάρκεια του πολέμου της διαδοχής.[5]
Ήταν μια αποτελεσματική βασίλισσα αντιβασιλέας και ένας μια πολύ ικανή κυβερνήτης, αφιερωμένη στους ισπανικούς εθνικούς προορισμούς.
Πέθανε από φυματίωση στις 14 Φεβρουαρίου 1714 σε ηλικία 25 ετών. Θάφτηκε στο Ελ Εσκοριάλ. Λίγους μήνες μετά το θάνατό της ο Φίλιππος ξαναπαντρεύτηκε, με την Ελισάβετ της Πάρμας.
Ονομάστηκε "Λα Σαβογιάνα" από του αγαπημένους της υπηκόους και ήταν πολύ αγαπητή στην Ισπανία.
Οικογένεια
Το 1701 η Μαρία Λουίζα παντρεύτηκε τον Φίλιππο Ε΄ της Ισπανίας και μαζί απέκτησαν τέσσερα παιδιά: