Μέχρι το 1955 ο οικισμός ονομαζόταν Λουσέστο.[3][4]
Γεωγραφία
Ο Άγιος Ιωάννης είναι ημιορεινός οικισμός στο δυτικό τμήμα του νομού Λασιθίου. Βρίσκεται στις νοτιοδυτικές υπώρειες της κορυφής «Λούτσι» (719 μ.), ανάμεσα στον Άγιο Νικόλαο και την Νεάπολη, και σε μέσο σταθμικό υψόμετρο 360. Απέχει 15 χλμ. περίπου ΒΔ. του Αγίου Νικολάου.[4][5][6][7][8]
Ο οικισμός αναγνωρίστηκε το 1925 ως Λουσέστο και προσαρτήθηκε στην κοινότητα Λιμνών. Το 1955 μετονομάστηκε σε Άγιος Ιωάννης. Με το ΦΕΚ 244Α - 04/12/1997 αποσπάστηκε από την κοινότητα Λιμνών και προσαρτήθηκε στον δήμο Αγίου Νικολάου.[3]