Picornavirales

Picornavirales

Darstellung Rhinovirus 16, Picornaviridae: Enterovirus

Systematik
Klassifikation: Viren
Realm: Riboviria[2][3]
Reich: Orthornavirae[1]
Phylum: Pisuviricota[1]
Klasse: Pisoniviricetes[1]
Ordnung: Picornavirales
Taxonomische Merkmale
Genom: (+)ssRNA linear
Baltimore: Gruppe 4
Symmetrie: ikosaedrisch
Hülle: keine
Wissenschaftlicher Name
Picornavirales
Links
ICTV Taxon History: 201901910
NCBI Taxonomy: 464095

Picornavirales ist eine Ordnung von Viren, die im Jahr 2009 zur taxonomischen Klassifizierung von dem offiziellen Gremium für Virustaxonomie (ICTV) angenommen wurde. Bis dahin sprach man von einer Picornavirus-Supergruppe, um die enge Verwandtschaft aufzuzeigen. Die Picornavirales fassen verschiedene Familien und Gattungen zusammen, die unbehüllte Viren mit einer einzelsträngigen RNA mit positiver Polarität enthalten und bei denen die Anordnung der Gene und phylogenetische Analysen der viralen RNA-Polymerase und Helikase eine nahe Verwandtschaft aufzeigen. Alle Vertreter der Ordnung besitzen nur einen Offenen Leserahmen, der für ein Polyprotein codiert. Innerhalb der Ordnung besitzen die Viruspartikel (Virionen) der verschiedenen Virusgruppen auch einen gleichförmigen Aufbau des Kapsids mit einer Pseudo-(T=3)-Symmetrie.

Systematik

Innere Systematik

Die Ordnung Picornavirales umfasst die folgende Virusfamilien (Stand 1. April 2024):[4][5]

  • Spezies Jericarnavirus B (ehem. Typus) mit Marine RNA virus JP-B[8][9]
  • Spezies Sanfarnavirus 1
  • Spezies Sanfarnavirus 2
  • Spezies Sanfarnavirus 3
  • Spezies Heterosigma akashiwo RNA virus (HaRNAV, Typus)[10] – wohl zu unterscheiden von der Spezies Heterosigma akashiwo virus 01 (HaV01/HaV-1) mit ihrem Subtyp Hav53
  • Familie Noraviridae
  • Unterfamilie Comovirinae (frühere Familie Comoviridae)
  • ohne zugewiesene Unterfamilie:
  • ohne zugewiesene Familie:
  • Gattung „Fesavirus“ (alias „Feline stool-associated RNA virus“)
  • Spezies „Fesavirus 1“
  • Spezies „Fesavirus 3“
  • Spezies „Fesavirus 4“
  • Gattung „Fisavirus“ (alias „Fish stool-associated RNA virus“)
  • Gattung „Husavirus“ (alias „Human stool-associated RNA viruses“)[18][19]
  • Spezies „Husa-like virus KS-2016a“
  • Spezies „Husavirus ACS160“
  • Spezies „Husavirus ACS178“
  • Spezies „Husavirus ACS200“
  • Spezies „Husavirus VSAD“
  • Spezies „Husavirus XZ110_XZ_CHN_2017“
  • Spezies „Husavirus XZ111_XZ_CHN_2017“
  • Spezies „Husavirus XZ112_XZ_CHN_2017“
  • Spezies „Husavirus XZ114_XZ_CHN_2017“
  • Spezies „Husavirus XZ115_XZ_CHN_2017“
  • Spezies „Husavirus XZ93_XZ_CHN_2017“
  • Spezies „Husavirus XZ97_XZ_CHN_2017“
  • Spezies „Husavirus XZ98_XZ_CHN_2017“
  • Spezies „Husavirus XZ99_XZ_CHN_2017“
  • Gattung „Posavirus“ (alias „Porcine stool-associated RNA virus“)[20][19]
  • Spezies „Posavirus 1“
  • Spezies „Posavirus 2“
  • Spezies „Posavirus 3“
  • Spezies „Posavirus 4“
  • Spezies „Posavirus 12“
  • (etliche weitere Stämme)…
  • Spezies „Picornavirales Tottori-HG1“
  • Spezies „Picornavirales Tottori-HG2“
  • Spezies „Picornavirales Tottori-HG3“
  • Spezies „Picornavirales Tottori-HG4“
  • ohne Gattungszuweisung (inkl. weiterer möglicher Kladen)
  • …

Äußere Systematik

Koonin et al haben 2015 die Picornavirales taxonomisch (aufgrund ihrer Verwandtschaft) zusammen mit einer Reihe weiterer Virusfamilien der von ihnen postulierten Supergruppe „Picornavirus-like superfamily“ zugeordnet.[22] Der Stammbaum dieser Supergruppe ist nach den Autoren wie folgt:[23]


 „Picornavirus-like superfamily“  



Picornavirales


   


Potyviridae


   

Hypoviridae[24] (dsRNA)



   

Astroviridae[25] (mit Mamastrovirus und Avastrovirus)




   

Luteoviridae[26] (mit Blattrollvirus, Wasserrübenvergilbungsvirus und Gelbverzwergungsviren)


   

Barnaviridae[27]




   


?Picobirnaviridae[28] (dsRNA)


   

Amalgaviridae[29] (dsRNA)


   

Partitiviridae[30] (dsRNA)


   


Megabirnaviridae[31] (dsRNA)


   

Chrysoviridae[32] (dsRNA)



   

Quadriviridae[33] (dsRNA)


   

Totiviridae (dsRNA)




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Caliciviridae




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Die Mitglieder dieser mutmaßlichen Supergruppe gehören verschiedenen Gruppen der Baltimore-Klassifikation an, in der Regel handelt es sich um einzelsträngige RNA-Viren positiver Polarität ((+)ssRNA, Baltimore-Gruppe 4), es sind aber auch – wie die Totiviridae und Hypoviridae – viele doppelsträngige Vertreter (mit dsRNA gekennzeichnet, Baltimore-Gruppe 3) zu finden.

ICTV Master Species List #35

Mit der neuen Master species List des ICTV, ratifiziert im März 2020, ergibt sich abweichend folgendes Bild:[3]

 Orthornavirae  
 Pisuviricota 
 Stelpaviricetes 

Patatavirales – Potyviridae[34]


  

Stellavirales – Astroviridae[35] (mit Mamastrovirus und Avastrovirus)



 Pisoniviricetes 
 Picornavirales[1] 

Caliciviridae


   

Dicistroviridae


   

Iflaviridae (mit Flügeldeformationsvirus und Sackbrut-Virus)


   

Marnaviridae


   

Picornaviridae


   

Polycipiviridae


   

Secoviridae


   

Solinviviridae


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 Sobelivirales 

Alvernaviridae


   

Barnaviridae[36]


   

Solemoviridae


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 Duplopiviricetes – Durnavirales 

Amalgaviridae[37] (dsRNA)


   

Hypoviridae[38] (dsRNA)


   

Partitiviridae[39] (dsRNA)


   

Picobirnaviridae[40] (dsRNA)


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 Duplornaviricota 
 Chrymotiviricetes – Ghabrivirales 

Chrysoviridae[41] (dsRNA)


   

Megabirnaviridae[42] (dsRNA)


   

Quadriviridae[43] (dsRNA)


   

Totiviridae[44] (dsRNA)


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Resentoviricetes – Reovirales – Reoviridae[45] (dsRNA)


   

Vidaverviricetes – Mindivirales – Cystoviridae


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Kitrinoviricota – Tolucaviricetes – Tolivirales – Luteoviridae[46] (mit Blattrollvirus, Wasserrübenvergilbungsvirus und Gelbverzwergungsviren)


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Von den Kitrinoviricota sind nur die oben bereits genannten Luteoviridae gelistet, weitere Phyla des Reichs Orthornavirae sind hier nicht berücksichtigt. Die „Picornavirus-like superfamily“ deckt sich im Wesentlichen mit den beiden Phyla Pisuviricota und Duplornaviricota der Orthornavirae (zu denen aber noch andere Phyla gehören).

Literatur

  • P. Christian, C. M. Fauquet et al.: Taxonomic Proposal to the ICTV Executive Committee, 17. Oktober 2007 (Volltextzugang)
  • O. Le Gall, P. Christian et al.: Picornavirales, a proposed order of positive-sense single-stranded RNA viruses with a pseudo-T = 3 virion architecture. Arch Virol. (2008) 153(4): S. 715–727 PMID 18293057
  • H. Sanfaçon, J. Wellink et al.: Secoviridae: a proposed family of plant viruses within the order Picornavirales that combines the families Sequiviridae and Comoviridae, the unassigned genera Cheravirus and Sadwavirus, and the proposed genus Torradovirus. Arch Virol. (2009) 154(5): S. 899–907 PMID 19350366
  • A. N. Lukashev: Role of recombination in evolution of enteroviruses. Rev Med Virol. (2005) 15(3): S. 157–167 (Review) PMID 15578739

Einzelnachweise

  1. ↑ a b c d ICTV: ICTV Taxonomy history: Enterovirus C, EC 51, Berlin, Germany, July 2019; Email ratification March 2020 (MSL #35)
  2. ↑ ICTV Master Species List 2018b v1 MSL #34, Feb. 2019
  3. ↑ a b ICTV: ICTV Master Species List 2019.v1, New MSL including all taxa updates since the 2018b release, March 2020 (MSL #35)
  4. ↑ ICTV: Taxonomy Browser.
  5. ↑ ICTV: Virus Metadata Resource (VMR).
  6. ↑ ICTV: ICTV Taxonomy history: Rabbit hemorrhagic disease virus, EC 51, Berlin, Germany, July 2019; Email ratification March 2020 (MSL #35)
  7. ↑ SIB: Marnaviridae, auf: ViralZone
  8. ↑ NCBI: Jericarnavirus B (species)
  9. ↑ Alexander L. Greninger, Joseph L. DeRisi: Draft Genome Sequences of Marine RNA Viruses SF-1, SF-2, and SF-3 Recovered from San Francisco Wastewater, in: Genome Announc. 3(3), Mai-Juni 2015, Epub 18. Juni 2015, e00653-15 doi:10.1128/genomeA.00653-15, PMC 4472900 (freier Volltext), PMID 26089423.
  10. ↑ NCBI: Heterosigma akashiwo RNA virus (species)
  11. ↑ SIB: Cheravirus, auf: ViralZone
  12. ↑ Young Hun Chung, Zhongchao Zhao, Eunkyeong Jung, Anthony O. Omole, Hanyang Wang, Lucas Sutorus, Nicole F. Steinmetz: Systemic Administration of Cowpea Mosaic Virus Demonstrates Broad Protection Against Metastatic Cancers. In: Advanced Science, Band 11, Nr. 18, 15. Mai 2024, S. 2308237; doi:10.1002/advs.202308237, Epub 2. März 2024 (englisch). Dazu:
  13. ↑ SIB: Fabavirus, auf: ViralZone
  14. ↑ SIB: Nepovirus, auf: ViralZone
  15. ↑ NCBI: Strawberry latent ringspot virus (species)
  16. ↑ SIB: Cheravirus, auf: ViralZone
  17. ↑ SIB: Sadwavirus, auf: ViralZone
  18. ↑ NCBI: Husavirus (genus)
  19. ↑ a b c Eda Altan, Kristen Aiemjoy, Tung G. Phan, Xutao Deng, Solomon Aragie, Zerihun Tadesse, Kelly E. Callahan, Jeremy Keenan, Eric Delwart: Enteric virome of Ethiopian children participating in a clean water intervention trial, in: Plos One, 16. August 2018, doi:10.1371/journal.pone.0202054
  20. ↑ NCBI: Posavirus (genus)
  21. ↑ NCBI: Picornavirales Tottori (list)
  22. ↑ Da diese Gruppe (von den Autoren als englisch superfamily bezeichnet) mit den Picornavirales eine Ordnung enthält, muss ihr Rang höher sein als dieser und ist nicht etwa als Überfamilie zu verstehen. Ränge höher als Ordnung waren zum Zeitpunkt der Arbeit vom ICTV aber noch gar nicht vorgegeben.
  23. ↑ Eugene V. Koonin, Valerian V. Dolja, Mart Krupovic: Origins and evolution of viruses of eukaryotes: The ultimate modularity, in: Virology Mai 2015; 479–480. 2–25. PMC 5898234 (freier Volltext), PMID 25771806.
  24. ↑ SIB: Hypoviridae, auf: ViralZone
  25. ↑ SIB: Astroviridae, auf: ViralZone
  26. ↑ SIB: Luteoviridae, auf: ViralZone
  27. ↑ SIB: Barnaviridae, auf: ViralZone
  28. ↑ SIB: Picobirnaviridae, auf: ViralZone
  29. ↑ SIB: Amalgaviridae, auf: ViralZone
  30. ↑ SIB: Partitiviridae, auf: ViralZone
  31. ↑ SIB: Megabirnaviridae, auf: ViralZone
  32. ↑ SIB: Chrysoviridae, auf: ViralZone
  33. ↑ SIB: Quadriviridae, auf: ViralZone
  34. ↑ ICTV: ICTV Taxonomy history: Lily mottle virus, EC 51, Berlin, Germany, July 2019; Email ratification March 2020 (MSL #35)
  35. ↑ ICTV: ICTV Taxonomy history: Avastrovirus 1, EC 51, Berlin, Germany, July 2019; Email ratification March 2020 (MSL #35)
  36. ↑ ICTV: ICTV Taxonomy history: Mushroom bacilliform virus, EC 51, Berlin, Germany, July 2019; Email ratification March 2020 (MSL #35)
  37. ↑ ICTV: ICTV Taxonomy history: Allium cepa amalgavirus 1, EC 51, Berlin, Germany, July 2019; Email ratification March 2020 (MSL #35)
  38. ↑ ICTV: ICTV Taxonomy history: Cryphonectria hypovirus 1, EC 51, Berlin, Germany, July 2019; Email ratification March 2020 (MSL #35)
  39. ↑ ICTV: ICTV Taxonomy history: Beet cryptic virus 1, EC 51, Berlin, Germany, July 2019; Email ratification March 2020 (MSL #35)
  40. ↑ ICTV: ICTV Taxonomy history: Human picobirnavirus, EC 51, Berlin, Germany, July 2019; Email ratification March 2020 (MSL #35)
  41. ↑ ICTV: ICTV Taxonomy history: Amasya cherry disease associated chrysovirus, EC 51, Berlin, Germany, July 2019; Email ratification March 2020 (MSL #35)
  42. ↑ ICTV: ICTV Taxonomy history: Rosellinia necatrix megabirnavirus 1, EC 51, Berlin, Germany, July 2019; Email ratification March 2020 (MSL #35)
  43. ↑ ICTV: ICTV Taxonomy history: Rosellinia necatrix quadrivirus 1, EC 51, Berlin, Germany, July 2019; Email ratification March 2020 (MSL #35)
  44. ↑ ICTV: ICTV Taxonomy history: Saccharomyces cerevisiae virus L-A, EC 51, Berlin, Germany, July 2019; Email ratification March 2020 (MSL #35)
  45. ↑ ICTV: ICTV Taxonomy history: Bluetongue virus, EC 51, Berlin, Germany, July 2019; Email ratification March 2020 (MSL #35)
  46. ↑ ICTV: ICTV Taxonomy history: Alfalfa enamovirus 1, EC 51, Berlin, Germany, July 2019; Email ratification March 2020 (MSL #35)

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