Bei den Kongresswahlen des Jahres 1812 für den 13. Kongress wurde er im 16. Wahlbezirk von New York in das US-Repräsentantenhaus in Washington, D.C. gewählt, wo er am 4. März 1813 als erster Vertreter des Distrikts im US-Repräsentantenhaus seinen Dienst antrat, nachdem der Distrikt 1809 abgeschafft wurde. Er schied nach dem 3. März 1815 aus dem Kongress aus.
Miller vertrat im Juli 1819 die Bundesregierung bei den Vertragsverhandlungen zwischen den Seneca und den Eigentümern der Seneca Reservation in Buffalo im Erie County. Am 16. November 1824 verstarb er in Utica und wurde dann auf dem Rural Cemetery in Albany beigesetzt.