Huber, Sohn des Ingenieurs Franz Huber (1882–1964) und dessen Ehefrau Barbara geborene Eberth (1892–1963)[1]
, wurde 1946 im Alter von 18 Jahren Vorsitzender des Bezirksverbands Oberbayern der Jungen Union und übte dieses Amt bis 1959 aus. Er studierte nach dem Abitur 1947[2] von 1948 bis 1951 Rechtswissenschaften und Volkswirtschaft in München. 1948/49 war er stellvertretender Vorsitzender der Münchener CSU.
1953 bis 1955 war er Sachbearbeiter in der Bayerischen Staatskanzlei, danach Gerichtsassessor. Von 1958 bis 1962 amtierte Huber als Staatsanwalt. 1959 wurde er mit der Dissertationsschrift Die Zwangsvollstreckung in das Anwartschaftsrecht des Vorbehaltskäufers promoviert.
Seit 1958 war er Mitglied des Bayerischen Landtags und seit 1959 Mitglied des CSU-Landesvorstandes. Von Dezember 1962 bis März 1972 hatte Huber den CSU-Fraktionsvorsitz inne,[3] zudem war er von 1963 bis 1970 einer der stellvertretenden CSU-Vorsitzenden.
Von 1977 bis 1988 war Huber Präsident der Bayerischen Landesbank. Er trat im Zuge der Wienerwald-Affäre zurück wegen seiner privaten und geschäftlichen Verbindungen zur Wienerwald-Erwerberin Renate Thyssen.[4]
Kritisiert wurde die unübliche Ämterhäufung (Fraktionsvorsitz und Ministeramt), die Huber acht Jahre behaupten konnte. Als Kultusminister stand er im Zentrum von Angriffen der Studentenbewegung von 1968. Unter dem Druck eines Volksbegehrens schaffte er die Bekenntnisschule ab.
Huber war seit 1953 mit Waltraud Nothhaft verheiratet. Aus der Ehe gingen die Söhne Alexander und Wolfgang hervor.[5]