Bicaudaviridae

Bicaudaviridae

Bicaudavirus

Systematik
Klassifikation: Viren
Realm: nicht klassifiziert[1]
Reich: nicht klassifiziert[1]
Phylum: nicht klassifiziert[1]
Klasse: nicht klassifiziert[1]
Ordnung: nicht klassifiziert[1]
Familie: Bicaudaviridae[1]
Gattung: Bicaudavirus
Taxonomische Merkmale
Genom: dsDNA zirkulär
Baltimore: Gruppe 1
Symmetrie: zitronenförmig
Hülle: ?
Wissenschaftlicher Name
Bicaudaviridae
Links
ICTV Taxon History: 201902737
NCBI Taxonomy: 2732902 (Familie),
352476 (Gattung)
ViralZone (Expasy, SIB): 713 (Familie),
742 (Gattung)

Bicaudaviridae ist die offizielle Bezeichnung einer Familie von Viren mit Doppelstrang-DNA-Genom. Ihre natürlichen Wirte sind hyperthermophile Archaeen der Familie Sulfolobaceae im Phylum Thermoproteota (mit Gattungen Acidianus, Sulfolobus, Saccharolobus)[A. 1] Derzeit (Stand Mitte März 2021) gibt es in der Familie Bicaudaviridae vom International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) bestätigt nur die eine Gattung Bicaudavirus mit der Art Bicaudavirus pozzuoliense, und diese mit dem Acidianus two-tailed virus (ATV).[2][3][1]

Der Name leitet sich ab von den lateinischen Wörtern bi und cauda ab, was so viel wie Zweischwanz oder Doppelschwanz bedeutet.

Aufbau

Die Virionen (Virusteilchen) der Bicaudaviridae sind möglicherweise umhüllt und haben eine zitronenförmige Geometrie. Das Genom ist unsegmentiert (monopartit) und besteht aus einem zirkulär geschlossenen dsDNA-Molekül mit einer Länge von etwa 62 kbp (Kilobasenpaaren). Es hat 72 offene Leserahmen (en. open reading frames, ORFs).[3]

Reproduktionszyklus

EM-Aufnahmen, den Reproduktionszyklus von ATV im Wirt Acidianus convivator (Crenarchaeota) dokumentierend.

Die Reproduktion der Viren erfolgt im Zytoplasma der Wirtszellen. Der Eintritt in die Wirtszelle (Infektion) erfolgt durch Anlagerung der Virus-Proteine an Wirtsrezeptoren, wodurch eine Endozytose vermittelt wird. Die Virus-DNA dient als Vorlage für die Transkription (en. DNA-templated transcription). Der Austritt aus der Wirtszelle erfolgt durch Knospung (en. budding). Die Übertragung der Virusteilchen geschieht durch passive Diffusion.[3]

Forschungsgeschichte

Die Familie Bicaudaviridae wurde erstmals von dem Team um D. Prangishvili im Jahr 2005 beschrieben.[4][5]

Systematik

Die Systematik ist nach ICTV (Stand Mai 2024)[6][7] und National Center for Biotechnology Information (NCBI – Vorschläge, in doppelten Anführungszeichen, Stand Mitte Juli 2024)[8][9] mit Stand Mitte März 2021 wie folgt:

Gruppe: dsDNA (Baltimore: 1)

Familie: Bicaudaviridae

  • Gattung: Bicaudavirus
    • Spezies: Bicaudavirus pozzuoliense mit Acidianus two-tailed virus (ATV)[10]
    • Spezies: „Acidianus two-tailed virus 2“ (ATV-2)[11]
    • Spezies: „Acidianus two-tailed virus variant 1“[12]
  • Gattung „Betabicaudavirus“[13]
    • Spezies: „Sulfolobus-Virus STSV1“ (englisch „Sulfolobus virus STSV1“ alias „Sulfolobus tengchongensis spindle-shaped virus 1“, STSV-1)[14]
    • Spezies: „Sulfolobus virus STSV2“ (en. „Sulfolobus virus STSV2“ alias „Sulfolobus tengchongensis spindle-shaped virus 2“, STSV-2)[15]
  • ohne Gattungszuordnung:
    • Spezies: „Acidianus tailed spindle virus“ (ATSV-1)
    • Spezies: „Sulfolobus monocaudavirus SMV1“ (SMV-1)[10]
    • Spezies: „Sulfolobus monocaudavirus SMV2“ (SMV-2)
    • Spezies: „Sulfolobus monocaudavirus SMV3“ (SMV-3)
    • Spezies: „Sulfolobus monocaudavirus SMV4“ (SMV-4)

Die beiden obigen vorgeschlagenen Species STSV1 und STSV2 sind wohl zu unterscheiden von den beiden folgenden ICTV-bestätigten Spezies:

  • Spezies Sulfolobus spindle-shaped virus 1 (SSV-1)[16][1]
  • Spezies Sulfolobus spindle-shaped virus 2 (SSV-2)[17][1]

der Gattung Alphafusellovirus in der Familie Fuselloviridae.

Anmerkungen

  1. ↑ Einige Gattungen von Sulfolobus (offenbar aber nicht S. tengchongensis) wurden in neuerer Zeit nach Saccharolobus verschoben:
    • LPSN: Saccharolobus, Sulfolobus, S. shibatae, S. solfataricus
    • Hiroyuki D. Sakai, Norio Kurosawa: Saccharolobus caldissimus gen. nov., sp. nov., a facultatively anaerobic iron-reducing hyperthermophilic archaeon isolated from an acidic terrestrial hot spring, and reclassification of Sulfolobus solfataricus as Saccharolobus solfataricus comb. nov. and Sulfolobus shibatae as Saccharolobus shibatae comb. nov, in: Int J Syst Evol Microbiol 68(4), April 2018, S. 1271–1278, Epub 27. Februar 2018, doi:10.1099/ijsem.0.002665, PMID 29485400
    • Anh Le-Cook, James Musser: Sulfolobus/Saccharolobus, Extreme Viruses Lab (Stedman Lab)

Weiterführende Literatur

Einzelnachweise

  1. ↑ a b c d e f g h i ICTV: ICTV Master Species List 2019.v1, New MSL including all taxa updates since the 2018b release, March 2020 (MSL #35)
  2. ↑ David Prangishvili, Mart Krupovic et al.: ICTV Virus Taxonomy Profile: Bicaudaviridae. In: The Journal of General Virology. 99. Jahrgang, Nr. 7, 7. Juni 2018, S. 864–865, doi:10.1099/jgv.0.001106, PMID 29877786 (englisch).
  3. ↑ a b c Viral Zone. Expasy, abgerufen am 18. März 2021 (englisch).
  4. ↑ Häring M, Vestergaard G, Rachel R, Chen L, Garrett RA and Prangishvili D (2005) Independent virus development outside a host. Nature 436, 1101–1102
  5. ↑ Prangishvili, D., Vestergaard G, Häring M, Aramayo R, Basta T, Rachel R and Garrett RA (2006) Structural and genomic properties of the hyperthermophilic archaeal virus ATV with an extracellular stage of the reproductive cycle. J. Mol. Biol. 359, S. 1203–1216
  6. ↑ ICTV: Taxonomy Browser.
  7. ↑ ICTV: Virus Metadata Resource (VMR).
  8. ↑ NCBI: Bicaudaviridae (family)
  9. ↑ Andrew M. Kropinski, Stuart G. Siddell: ICTV: ICTV Report Bicaudaviridae, Mai 2018
  10. ↑ a b Fengbin Wang, Virginija Cvirkaite-Krupovic, Matthijn Vos, Leticia C. Beltran, Mark A. B. Kreutzberger, Jean-Marie Winter, Zhangli Su, Jun Liu, Stefan Schouten, Mart Krupovic, Edward H. Egelman: Spindle-shaped archaeal viruses evolved from rod-shaped ancestors to package a larger genome. In:
  11. ↑ NCBI: Acidianus two-tailed virus 2 (species)
  12. ↑ NCBI: Acidianus two-tailed virus variant 1 (species)
  13. ↑ Mart Krupovic, Emmanuelle R. J. Quemin, Dennis H. Bamford, Patrick Forterre, David Prangishvili: Unification of the globally distributed spindle-shaped viruses of the Archaea. In: Journal of Virology. 88. Jahrgang, Nr. 4, 2014, ResearchGate:259320195, S. 2354​–2358, doi:10.1128/JVI.02941-13, PMID 24335300, PMC 3911535 (freier Volltext) – (englisch).
  14. ↑ NCBI: Sulfolobus virus STSV1 (unclassified species)
  15. ↑ NCBI: Sulfolobus virus STSV2 (unclassified species)
  16. ↑ NCBI: Sulfolobus spindle-shaped virus 1 (ICTV accepted species)
  17. ↑ NCBI: Sulfolobus spindle-shaped virus 2 (ICTV accepted species)

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