Seznam mlýnů v Praze obsahuje převážně vodní mlýny, zachovalé i zaniklé, při řece Vltavě na území Prahy a na potocích v pražských čtvrtích na pravém a levém břehu Vltavy. V závorce kurzívou jsou uvedeny další názvy mlýnů. Seznam není úplný.

• Akciové parní mlýny – Holešovice (1909–1911)
• Parní mlýn Odkolek – Vysočany čp. 256 (1910–1911)^[1]
• Hostivařský parní mlýn – Hostivař, čp. 1309 (1920–1923 Bohumil Hübschmann)^[2]
• Nuselský parní mlýn – Nusle (1909)
• Písnický parní mlýn – Písnice, Putimská 5/6
• Sovovy mlýny – Odkolkův parní mlýn na Kampě zničený požárem roku 1896 (1872)

• Větrný mlýn na Strahově
• Větrný mlýn (Břevnov)

• Komořanské mlýny – Komořany, zanikly
• Starý mlýn – Modřany, Komořanská 52, zanikl
• Hartlův mlýn (Pardubův, Jezuitský, Kropáčův) – Smíchov, Nábřežní 87/8
• Petržilkovský mlýn (Kartouzský) – Smíchov, Nábřežní 90/4
• Šítkovské mlýny (Novoměstské) – Nové Město, Masarykovo nábřeží 249
• Kartouzské mlýny (Horní Lodecké) – Nové Město, Masarykovo nábřeží, zanikly
• Šerlinské mlýny (Horní Lodecké, Lodní) – Nové Město, Masarykovo nábřeží, zanikly
• Huťský mlýn (Dolní, Všehrdský, Zbrojnický) – Čertovka, Malá Strana, Všehrdova 449, kulturní památka
• Zlomkovský mlýn (Maltézský, Wendingerovský) – Čertovka, Malá Strana, Nosticova 469/6, kulturní památka
• Velkopřevorský mlýn (Štěpánovský) – Čertovka, Malá Strana, Hroznová 489/3, kulturní památka
• Sovovy mlýny (Odkolkovy) – Malá Strana, U Sovových mlýnů 503/2, Museum Kampa, kulturní památka
• Johanitské mlýny (Augustinovy) – Nové Město, Smetanovo nábřeží, zanikly
• Staroměstské mlýny (8 mlýnů) – Staré Město, Novotného lávka
  • Karlovy lázně – bývalý mlýn
• Mlýny Na Pískách (Pod Hradem) – Malá Strana, Kosárkovo nábřeží, zanikly
• Olbramovské mlýny (Menhartovy, Žárovské) – Staré Město, Alšovo nábřeží 12, zanikly
• Vávrův mlýn^{[p 1]} (Michalovicův, Nový) – Nové Město, Nové mlýny 1239/2, kulturní památka
• Dolní Lodecké mlýny (Loďkové, Lodní) – Nové Město, Klimentská 1222/27, zanikly
• Helmovy mlýny (Kubešovy) – Nové Město, Klimentská 29, zanikly
• Buriánkův mlýn – Karlín, Pobřežní 3, zanikl
• Mlýn Na Kameni (Kamenský, Rohanský, Šaškovský) – Karlín, čp. 10, zanikl
• Trojský mlýn – Troja, Povltavská 5/74
• Císařský mlýn – Bubeneč, Mlýnská 22, kulturní památka

• Drahanský mlýn – Drahanský potok, Čimice, K Drahani 815
• Chvalský mlýn – Chvalka, Horní Počernice-Chvaly, Stoliňská 920/41
• Královický mlýn – Rokytka, Královice, Kuťatská, původní č.p. 20, zanikl
• Stachův mlýn – Běchovice, K Jalovce 11
• Dolnopočernický mlýn – Dolní Počernice, Národních hrdinů 2
• Kyjský mlýn – Kyje, Lednická 17
• Výsadní mlýn (Špitálský, Horní) – Hrdlořezy, Pod Smetankou č.p. 16, zanikl
• Kejřův mlýn – Hloubětín, K náhonu 988/3, Kulturní památka
• Mlýn v Podviní – Libeň, Podvinný mlýn 73, zanikl
• Malý mlýn – Libeň, Na Rokytce č.p. 30, zanikl
• Löwitův mlýn (Velký) – Libeň, U Českých loděnic 40, Kulturní památka
• Kolovratský mlýn – Říčanský potok (přítok Rokytky), Kolovraty, Do Lipan 9/18
• Mlýn v Uhříněvsi (Starý) – Uhříněves, U Starého mlýna 19/11
• Podleský mlýn – Dubeč, Podlesek 88/1, zanikl
• Dubečský mlýn – Dubeč, Netlucká 1
• Bezovka – Olšanský potok, Žižkov, zanikl
• Koníčkův mlýn (Újezd) – Botič, Újezd u Průhonic, Ke mlýnu 11, zanikl, Kulturní památka
• Fantův mlýn – Křeslice, zanikl
• Petrovický mlýn – Petrovice, Grammova 13, zanikl
• Mouchův mlýn – Hostivař, zanikl
• Švehlův mlýn (Hořejší) – Hostivař, Selská 44/36, Kulturní památka
• Dolejší mlýn – Hostivař, K Horkám 16/23, Kulturní památka
• Práčský mlýn – Záběhlice-Práče, Práčská 1885/12, Kulturní památka
• Záběhlický mlýn (Na Hamru) – Záběhlice, Podle náhonu 69, zanikl
• Michelský mlýn – Michle, U Michelského mlýna 24/3, zanikl
• Vršovický mlýn – Vršovice, Petrohradská 3, zanikl
• Nuselský mlýn – Nusle, Křesomyslova 19, zanikl
• Folimanka – Vinohrady, zanikl
• Kapitulní mlýn (Botičský, Fabiánovský, Vyšehradský) – Nové Město, Na Výtoni 254/2, Kulturní památka
• mlýn v Dobré Vodě – Dobrá Voda, Křeslice, Na Dobré vodě 39
• Benický mlýn – Pitkovický potok, Benice č.p. 10
• Mlýn v Pitkovičkách – Pitkovice-Pitkovičky, původní č.p. 20, zanikl
• Hořejší mlýn (Kunratice) – Kunratický potok, Kunratice, K Verneráku 43/33, zanikl
• Bartůňkův mlýn (Dolejší) ­– Kunratice, K Borovíčku 45
• Podhradní mlýn – Kunratice, zanikl
• Krčský mlýn – Krč, Před nádražím 745/4, zanikl
• Branický mlýn (Trojanův) – Braník, Za Mlýnem 38, zanikl
• Mlejnek – Braník, Na Mlejnku, zanikl
• Rážův mlýn (Podskalský) – Libušský potok, Modřany, K dolům, původní č.p. 33, zanikl

• Trojanův mlýn (Přední) – Únětický potok, Suchdol, č.p. 16/2, Kulturní památka
• Tůmův mlýn (Zadní, Zbořený) – Suchdol, č.p. 17, zbořen
• Spálený mlýn – Suchdol, č.p. 26/5
• Ruzyňský mlýn – Šárecký potok, Ruzyně, Jinočanská, zbořen
• Libocký mlýn – Liboc, Libocká 175/58
• Hovorkův mlýn – Liboc, Divoká Šárka 356/1
• Čertův mlýn (Tučkův) – Liboc, Divoká Šárka 39/4, Kulturní památka
• Dubový mlýn – Dejvice-Jenerálka, Ke Kulišce 43
• Záporecký mlýn (Na posledním penízi, Kalinův) – Dejvice, V Šáreckém údolí 29
• Mlýnek – Dejvice, V Šáreckém údolí 25/85
• Malý mlýnek – Dejvice, V Šáreckém údolí 44/17
• Kalousovský mlýn (Podbabský) – Dejvice-Podbaba, V Podbabě 40/29
• Lysolajský mlýn - Lysolajský potok, Lysolaje, Starodvorská 13/2
• Lysolajský mlýn - Lysolaje, Lysolajské údolí 35
• Mlýn na Novém Světě - Brusnice, Hradčany, Černínská, zanikl
• Mlýn v Jelením příkopu - Hradčany, Chotkova silnice, zanikl
• Maltézský mlýn (Tomanovský, Motolský) – Motolský potok, Motol čp.10
• Košířský mlýnek – Košíře, Vrchlického, původní č.p. 11, zanikl
• Trunečkův mlýn – Dalejský potok, Řeporyje, čp. 25
• Mlýn Rohlov (Rohlovský, Suchý, Nový, Klokanův) – Holyně
• Horův mlýn (Klukovický) – Hlubočepy čp. 301
• Dalejský mlýn – Prokopské údolí, Jinonice, původní čp. 257
• Michnův mlýn – Hlubočepy, původní čp. 1
• Hlubočepský mlýn – Hlubočepy, původní čp. 20
• Červený mlýn – Zlíchov, osada Křenkov
• Malochuchelský mlýn – Mariánsko-Lázeňský potok, Malá Chuchle, V lázních 5/9

• Blukský mlýn – Berounka, Lipence-Dolní Černošice, Nad jezem 497
• Taslarův mlýn (Rutický, Brejchův, Hořejší, Podkopanský) – Radotínský potok, Zadní Kopanina, U Skopců č.p. 6
• Maškův mlýn (Špačkův, Brejchův, Zadní) – Zadní Kopanina, K Zadní Kopanině č.p. 30 (ev.7), Kulturní památka
• Mlýn Rutice (Špačkův mlýn) – Radotín, Na Cikánce č.p. 39
• Nový Kalinův mlýn (Radotín) – Radotín, Na Cikánce č.p. 39, zbořen 1985
• Šarbochův mlýn (Zemanův) – Radotín-Kosoř, Na Cikánce č.p. 28, zbořen 1958
• Drnův mlýn (Na Drnu, Přední Mašek) – Radotín, Na Cikánce č.p. 20, zbořen 1958
• Hadrovský mlýn (U Hadrů, Hadrový, Brouchův) – Radotín, K Cementárně č.p. 23
• Hořejší mlýn (Radotín) (Böhmův) – Radotín, Pod Klapicí č.p. 15
• Prostřední mlýn (Radotín) (Farářský, Panský, U Hamanů) – Radotín, nám.Osvoboditelů 9, Kulturní památka
• Dolejší mlýn (Radotín) (Šnajberkův, Smaltovna) – Radotín, Václava Balého č.p. 25

• Červený mlýn – Červenomlýnský potok, Ďáblice, U Červeného mlýnku 23
• Bílý mlýn – Čakovice, Bělomlýnská, zanikl
• Miškovický mlýn – Miškovice, Polabská 84
• Na mlejnku - Vinořský potok, Vinoř, Ke mlýnku 136, původní č.p. 44
• Dolejší mlýn - Vinoř, zanikl

• KLEMPERA, Josef. Vodní mlýny v Čechách. III., Praha a okolí. 1. vyd. Praha: Libri, 2001. 263 s. ISBN 80-7277-051-9.
• Technické památky v Čechách, na Moravě a ve Slezsku. Příprava vydání Jana Hlušičková. 1. vyd. vyd. Praha: Libri, 2003. 617 s. Dostupné online. ISBN 80-7277-043-8, ISBN 978-80-7277-043-4. OCLC 50161895 

• Usedlosti v Praze
• Seznam řek a potoků v Praze
• Seznam větrných mlýnů v Česku
• Seznam vodních mlýnů v Česku

• Obrázky, zvuky či videa k tématu Seznam mlýnů v Praze na Wikimedia Commons
• Vodní mlýny, databáze vodních mlýnů v Česku