Своєю грою за останню команду привернув увагу представників тренерського штабу клубу «Індепендьєнте Медельїн», до складу якого приєднався 2009 року. Відіграв за команду з Медельїна наступні чотири сезони своєї ігрової кар'єри і став з командою чемпіоном Клаусури 2009. Більшість часу, проведеного у складі «Індепендьєнте Медельїн», був основним гравцем команди.
Влітку 2013 року уклав контракт з «Брагою», яка заплатила за гравця 600 тис. євро[3]. У складі португальської команди провів наступні два роки своєї кар'єри гравця і також здебільшого виходив на поле в основному складі команди.
17 липня2015 року за 4,5 млн. євро перейшов у грецький «Олімпіакос», підписавши контракт на 5 років. 3 січня 2016 року в поєдинку проти «Паніоніса» Феліпе забив свій перший гол за команду з Пірея в чемпіонаті[4]. У своєму дебютному сезоні Пардо став чемпіоном Греції.
Залучався до юнацької збірної Колумбії, у складі якої був учасником чемпіонату світу серед юнацьких команд 2007 року в Південній Кореї, де зіграв 4 матчі і забив гол у ворота однолітків з Тринідаду і Тобаго.