Висота регіону знижується зі сходу на захід, від 1000 м над рівнем моря в передгір'ях Альбертінського рифту до 400 м над рівнем моря в долині річки Конго. На півночі, сході і північному сході регіону трапляються численні пагорби, уступи та інзельберги, а на заході рельєф переважно рівнинний. З геологічної точки зору на східній і північній окраїні екорегіону переважають докембрійські породи фундаменту, а далі на південь переважають більш пізні гірські породи, пов'язані з осіданням в басейні Конго. На більшій частині екорегіону ґрунти представлені товстим шаром сильно вилугованих оксісолів[en]. В південній частині регіону поширені нітосолі[en], які менше вивітрюються та більш придатні до вирощування сільськогосподарських культур. На сході вулканічна діяльність Альбертінського рифту також підвищила родючість ґрунтів.
Густота населення в центральній частині екорегіону становить менше 5 осіб/км². Найвища густота населення спостерігається на сході екорегіону, де вона становить 50 осіб/км². В малонаселеній центральній частині регіону мешкають представники народу Мбуті[en], яких зазвичай називають пігмеями[en]. Ці люди ведуть мисливсько-збиральницький спосіб життя.
Клімат
На більшій частині екорегіону переважає екваторіальний клімат (Af за класифікацією кліматів Кеппена), а на півночі — мусонний клімат (Am за класифікацією Кеппена). Середньорічна кількість опадів коливається від 1500 мм до 2000 мм і зменшується із заходу на схід. З січня по березень триває виражений сухий сезон. Середньорічна максимальна температура становить 27-33 °C, середньорічна мінімальна температура — 15-21 °C.
Флора
Рівнинні ліси Північно-Східного Конго є найсхіднішою частиною великого масиву конголезьких дощових лісів. Основними лісовими угрупованнями цього екорегіону є рівнинні вологі ліси. Подекуди в регіоні трапляються заболочені ліси, на сході поширені передгірські ліси, а на півночі — більш сухі перехідні ліси. Незважаючи на те, що на більшій частині екорегіону трапляються мішані вічнозелені або напіввічнозелені ліси, подекуди також зустрічаються невеликі або досить значні монодомінантні[en] ліси. Найпоширеніші монодомінантні насадження формують лімбалієві дерева[en] (Gilbertiodendron dewevrei), які також зустрічаються в інших гвінейсько-конголезьких лісах.
Загалом флора екорегіону характеризується високим різноманіттям та високим рівень ендемізму. В дощовому лісі Ітурі[en], розташованому на північному сході екорегіону, зареєстровано понад 1500 видів рослин. В екорегіоні зустрічається багато реліктових видів, деякі з яких вказують на зв'язки з лісами Камеруну та Габону. Флора інзельбергів, поширених в північній частині регіону, демонструє зв'язки з флорою гір Східної Африки.