Міністерство освіти і науки України є головним органом у системі центральних органів виконавчої влади, що забезпечує формування та реалізує державну політику у сферах освіти і науки, наукової, науково-технічної та інноваційної діяльності, трансферу (передачі) технологій, а також забезпечує формування та реалізацію державної політики у сфері здійснення державного нагляду (контролю) за діяльністю закладів освіти, підприємств, установ та організацій, які надають послуги у сфері освіти або провадять іншу діяльність, пов'язану з наданням таких послуг, незалежно від їх підпорядкування і форми власності[2].
Зараз Міністерство займає будівлю за адресою: Берестейський проспект, 8-10.
Будівля є пам'яткою культурної спадщини Києва, була збудована 1936—1937 рр., до Другої світової війни у будівлі знаходилася Промислова академія (Академія радянської торгівлі).
Директорат дошкільної, позашкільної та інклюзивної освіти. Головне управління дошкільної, позашкільної та інклюзивної освіти
- Експертна група з питань інклюзивної освіти
- Експертна група з питань позашкільної освіти
- Експертна група з питань дошкільної освіти
- Відділ освіти дітей з особливими потребами
- Відділ позашкільної освіти, виховної роботи
- Відділ дошкільної освіти
Директорат шкільної освіти. Головне управління шкільної освіти
- Експертна група з питань нормативно-правового забезпечення
- Експертна група з питань освітнього процесу
- Експертна група з питань децентралізації в освіті
- Експертна група з питань моніторингу провадження реформи
- Відділ змісту освіти, мовної політики та освіти національних меншин
- Відділ взаємодії з місцевими органами влади
Директорат професійної освіти. Головне управління професійної освіти
- Експертна група з питань змісту та забезпечення якості освіти
- Експертна група з питань управління та державно-приватного партнерства
- Відділ організаційної діяльності та соціальних питань
- Відділ змісту освіти та організації освітнього процесу
- Відділ взаємодії з соціальними партнерами та регіональними органами виконавчої влади
Директорат вищої освіти і освіти дорослих. Головне управління вищої освіти
- Експертна група з питань аналітики, фінансування та міжнародних зв'язків
- Експертна група з питань нормативно-правового забезпечення вищої освіти і освіти дорослих
- Експертна група з питань розвитку кваліфікацій, освіти дорослих та педагогічної освіти
- Відділ публічних закупівель послуг у сфері вищої освіти
- Відділ змісту освіти та модернізації освітнього процесу
- Відділ координації менеджменту закладів освіти
- Відділ організаційного забезпечення та контролю
Директорат науки та інновацій. Головне управління із реалізації політик у сфері науки та інновацій
- Експертна група з питань стратегій та узгодження політик
- Експертна група з питань розвитку науки
- Експертна група з питань розвитку інновацій
- Експертна група з питань моніторингу і оцінювання наукової, науково-технічної та інноваційної діяльності
- Експертна група з питань інтеграції до Європейського дослідницького простору
- Експертна група з питань міжнародної політики та організаційно-методичного забезпечення
- Відділ розвитку науки у закладах вищої освіти
- Відділ досліджень і розробок
- Відділ моніторингу наукової та інноваційної діяльності
- Відділ розвитку дослідницької та інноваційної інфраструктури
- Відділ міжнародного співробітництва у сфері науки та інновацій
Директорат стратегічного планування та європейської інтеграції
- Експертна група з аналітики
- Експертна група з питань бюджетування
- Експертна група із супроводження політики
- Експертна група з міжнародних питань
- Експертна група з питань цифрової трансформації освіти і науки
Департамент атестації кадрів вищої кваліфікації
Департамент фінансування державних і загальнодержавних видатків
Департамент правового забезпечення
Департамент кадрового забезпечення
Департамент забезпечення документообігу, контролю та інформаційних технологій
Управління бухгалтерського обліку та звітності
Управління з питань інформаційної політики та комунікацій
Управління міжнародного співробітництва та протоколу
Патронатна служба Міністра
Відділ внутрішнього аудиту
Сектор мобілізаційної роботи, цивільного захисту та безпеки життєдіяльності
Спецсектор