Імператор Ґо-Сай народився 1 січня1638 року. Він був сьомим сином Імператора Ґо-Мідзуноо. Матір'ю хлопчика була фрейліна Кусіґе Такако, донька лівого генерала Імператорської гвардії Кусіґе Такамуне. Новонародженому дали ім'я Наґахіто і титул принц Хіде[3].
Початково принц був спадкоємцем родини принців Такамацу, яка не мала хлопчиків для продовження роду. Однак 1654 року, після смерті старшого брата Імператора Ґо-Комьо, він був проголошений спадкоємцем японського престолу. 5 травня1655 року Наґахіто став новим Імператором Японії[3].
Протягом свого правління Імператор Ґо-Сай займався науками, вивчав японську поезію і складав вірші. Свої найкращі твори він видав у «Збірці водяного місця»[3][4].
↑До 1926 року в японських текстах зустрічався варіант імені «Імператор Ґо-Сай'їн» (яп.後西院天皇, ごさいいんてんのう, ґо-саіін тенно). Він походив титулу Імператора Дзюнна — Імператор Сай'їн. Після 1926 року в усіх наукових і публіцистичних виданнях вживається лише ім'я «Імператор Ґо-Сай» (Імператор Ґо-Сай // Енциклопедія Ніппоніка: в 26 т. 2-е видання. — Токіо: Сьоґаккан, 1994—1997.)