Церемонія нагородження MTV Europe Music Awards 2006 відбувся в Копенгагені в Bella Center^[en] та Площі Ратуші^[en]. На вуличній сцені відбувся концерт, на якому виступили The Killers, Keane та Snoop Dogg.

У церемонії взяли участь Fat Joe, Timbaland та Moby. Під час церемонії Каньє Вест увірвався на сцену, коли оголошували перемогу Justice vs. Simian^[en] у номінації «Найкраще відео».^[1]

Переможців виділено Жирним.

• Неллі Фуртаду — «Maneater»
• Gnarls Barkley^[en] — «Crazy»
• Red Hot Chili Peppers — «Dani California^[en]»
• Ріанна — «SOS»
• Шакіра (за участі Вайклефа Жана) — «Hips Don't Lie»

• Gnarls Barkley^[en] — «Crazy»
• Justice vs. Simian^[en] — «We Are Your Friends^[en]»
• OK Go — «A Million Ways^[en]»
• Pink — «Stupid Girls^[en]»
• Каньє Вест — «Touch the Sky»

• Крістіна Агілера — Back to Basics
• Неллі Фуртаду — Loose
• Мадонна — Confessions on a Dance Floor
• Muse — Black Holes & Revelations
• Red Hot Chili Peppers — Stadium Arcadium

• Крістіна Агілера
• Бейонсе
• Неллі Фуртаду
• Мадонна
• Шакіра

• Фаррелл
• Шон Пол
• Джастін Тімберлейк
• Каньє Вест
• Роббі Вільямс

• The Black Eyed Peas
• Depeche Mode
• Keane
• The Pussycat Dolls
• Red Hot Chili Peppers

• Gnarls Barkley^[en]

• Крістіна Агілера
• Мадонна
• Шакіра
• Джастін Тімберлейк
• Роббі Вільямс

• Evanescence
• Keane
• The Killers
• Red Hot Chili Peppers
• The Strokes

• Arctic Monkeys
• Korn
• Muse
• The Raconteurs
• System of a Down

• Бейонсе
• Мері Джей Блайдж
• Outkast
• Фаррелл
• Ріанна

• Busta Rhymes
• Міссі Еліот
• Шон Пол
• P. Diddy
• Каньє Вест

Переможців виділено Жирним.

• Олександра Ковач^[en]
• Let 3
• Едо Маайка
• Нейша^[en]
• Siddharta

• Freshlyground^[en]
• Nameless^[en]
• Juma Nature^[en]
• P-Square^[en]
• Ансельмо Ральф^[en]

• Brainstorm
• Inculto
• Skamp^[en]
• Танель Падар
• Vanilla Ninja

• Kashmir
• L.O.C.^[en]
• Nik & Jay^[en]
• Outlandish^[en]
• Spleen United^[en]

• Anouk
• Deus^[en]
• Kane^[en]
• Pete Philly & Perquisite^[en]
• Габріель Ріос^[en]

• Lordi
• PMMP^[en]
• Poets of the Fall
• Олаві Уусівірта^[en]
• Von Hertzen Brothers^[en]

• 113^[en]
• Diam's^[en]
• Rohff^[en]
• Олівія Руїс^[en]
• Боб Сінклер

• Bushido^[en]
• Die Toten Hosen
• Rammstein
• Silbermond^[en]
• Sportfreunde Stiller^[en]

• Lacuna Coil
• Тіціано Ферро
• Finley
• Джованотті
• Mondo Marcio

• Amulet^[en]
• Міра Крейг
• Маріт Ларсен
• Serena Maneesh^[en]
• Ельвіра Ніколайсен^[en]

• Blog 27^[en]
• Coma
• Hey
• Sistars^[en]
• Virgin^[en]

• Boss AC^[en]
• Expensive Soul^[en]
• Девід Фонсека^[en]
• Mind Da Gap
• Moonspell

• Blondy
• DJ Project^[en]
• Morandi
• Paraziţii
• Simplu

• Діма Білан
• Город 312
• Валерій Меладзе
• t.A.T.u.
• Uma2rman

• Nena Daconte^[en]
• La Excepción^[en]
• La Oreja de Van Gogh^[en]
• Macaco^[en]
• Pereza^[en]

• The Knife
• Ліса Місковскі
• Peter, Bjorn & John
• Snook^[en]
• The Sounds^[en]

• Лілі Аллен
• Arctic Monkeys
• The Kooks
• Muse
• Корінна Бейлі Рай^[en]

• Джастін Тімберлейк — «SexyBack^[en] / My Love^[en] / LoveStoned^[en]»
• Неллі Фуртаду — «Maneater»
• Muse — «Starlight»
• The Killers — «When You Were Young^[en]»
• Keane — «Is It Any Wonder?^[en]»
• P. Diddy та Кессі — «Come to Me^[en]»
• Ріанна — «SOS»
• Snoop Dogg (за участі Фаррелл Вільямс) — «Drop It Like It's Hot^[en]»
• Outlandish^[en] — «I'm Callin' You»
• Jet^[en] — «Rip It Up^[en]»
• Lordi — «Hard Rock Hallelujah^[en]»

• Moby — оголошення переможця у номінації Найкращий альтернативний виконавець
• Sugababes — оголошення переможця у номінації Найкращий співак
• Timbaland — оголошення переможця у номінації Найкраще відео
• Lordi — оголошення переможця у номінації Найкращий рок-виконавець
• Деніел Крейґ та Мадс Міккельсен — оголошення переможця у номінації Найкраща співачка
• Ларс Ульріх — оголошення переможця у номінації Звук Майбутнього
• Fat Joe — оголошення переможця у номінації Найкращий хіп-хоп виконавець
• Едрієн Броуді — оголошення переможця у номінації Найкращий гурт
• Кессі та Тіціано Ферро — оголошення переможця у номінації Найкращий поп-виконавець
• Келіс — оголошення переможця у номінації Найкращий R&B-виконавець
• Фаррелл Вільямс — оголошення переможця у номінації Найкраща пісня

• «Justin Timberlake to host the EMA's 2006» [Архівовано 20 листопада 2006 у Wayback Machine.] MTV Europe, 19 вересня 2006.
• MTV Europe [Архівовано 7 лютого 2010 у Wayback Machine.] Офіційний вебсайт.
• MTV Europe Music Awards [Архівовано 19 вересня 2020 у Wayback Machine.] Офіційний вебсайт шоу.
• Copenhagen For Partiers — The Ultimate Copenhagen Tourist Guide