Перша згадка про хутір Зруб датовано першою половиною XVII століття. Радянською владою після 1918 року було об'єднано хутір Зруб і хутір Нестеровича (станом на кінець ХVIII ст. хутором володів поручик Іван Нестерович) в село Зруб.
12 червня 2020 року, відповідно до розпорядження Кабінету Міністрів України № 730-р «Про визначення адміністративних центрів та затвердження територій територіальних громад Чернігівської області», увійшло до складу Вертіївської сільської громади[2].
19 липня 2020 року, в результаті адміністративно-територіальної реформи, увійшло до складу новоутвореного Ніжинського району[3].
