У дорослому футболі дебютував 1997 року виступами за команду клубу «Рапід» (Бухарест), в якій провів три сезони, взявши участь у 80 матчах чемпіонату. Протягом цих років виборов титул чемпіона Румунії, а також став володарем кубку та суперкубку країни.
Своєю грою за останню команду привернув увагу представників тренерського штабу клубу «Аякса», до складу якого приєднався 2000 року, проте в новій команді заграти не зміг і в кінці 2001 року був відданий в оренду до кінця сезону «Динамо» (Бухарест), в якому Лобонц допоміг команді здобути титул чемпіона Румунії.
Після повернення до «Аякса» Богдан так і не став основним голкіпером, хоча і здобув разом з командою титул чемпіона Нідерландів і на початку 2006 року перейшов у італійську «Фіорентину», де провів півтора сезони.
2009 року приєднався до італійської «Роми», ставши її резервним голкіпером. Протягом перших чотирьох років у команди відіграв за «вовків» 28 матчів в усіх турнірах. Протягом наступних трьох сезонів у жодній офіційній грі на клубному рівні участі не брав, утім влітку 2016 року отримав і прийняв пропозицію подовжити співпрацю з «Ромою» ще на два роки. Влітку 2018 року, так і не зігравши жодної гри за попередні п'ять років, оголосив про завершення ігрової кар'єри.
Загалом протягом кар'єри у збірній, що тривала 20 років, провів у формі головної команди країни 86 матчів.
Кар'єра тренера
Відразу по завершенні ігрової кар'єри 2018 року повернувся на батьківщину, очоливши тренерський штаб «Університаті» (Клуж-Напока), команди другого румунського дивізіону.
