1969 yılında Şanlıurfa'daki Kahraman Uyanışspor, Beşiktaş ve 11 Nisanspor kulüpleri birleşerek Şanlıurfaspor'u kurmuşlardır. 1971 yılında genç takım teşkil edilmiş, 1973 yılında amatör takım kurarak Urfa amatör lig maçlarına iştirak etmeye başlamıştır. İlk kulüp başkanı Mustafa Kılıç'tır. Forma rengini buğday filizinin yeşil ve buğday filizinin sararmaya yüz tuttuğu başak halindeki sarı renklerini alarak belirlemiştir.
1969-70 futbol sezonunda Şanlıurfaspor 3. Türkiye Ligi profesyonel ligde kırmızı grupta mücadele etmiştir. O dönem ligde ilk müsabakasını Kırşehirspor'la sahasında oynayarak 0-0 berabere kalmıştır. Türkiye 3. Ligi Kırmızı Grup bölgesel bir grup olmayıp Doğu, Güneydoğu, Karadeniz, İç Anadolu ve Akdeniz bölgelerinde bulunan mevcut takımlardan oluşmuş güçlü bir gruptu.
Kulüp, yaşadığı maddi kriz nedeniyle 2008 yılında kayyıma devredildi. Kayyum olarak atanan Şanlıurfa Belediye Başkanı, Şanlıurfa Belediyespor ile aynı grupta olan takımın UEFA kriterlerine göre ligde kalabilmesi için iki kulübün yöneticilerinin aynı kişilerden oluşmamasını sağladı. Kulüp başkanlığını sonraki dönemde Kemal Saraçoğlu yaptı. Futbol takımı 1. Lig'e yükseldikten sonra alınan sonuçlar nedeniyle Kemal Saraçoğlu istifa etti. Seçimli genel kurulda kulüp başkanlığına Fethi Şimşek getirildi. Fethi Şimşek'in istifasından sonra kongrede Fahri Başkanlığa Eski Eyyübiye Belediye Başkanı Mehmet Ekinci seçildi.[2]
2011-12 sezonunda 2. Lig Beyaz Grupta Şampiyon olarak 1. Lige yükseldi.[3] Aynı sezon Türkiye Kupası'nda da takım çeyrek finale kadar yükselmiş çeyrek finalde ise 2009-2010 Süper Lig şampiyonu Bursaspor'a 4-1'lik skorla boyun eğerek kupaya veda etmiştir. 4 Eylül 2011 tarihinde Şanlıurfaspor Süper Lig takımlarından Bursaspor ile GAP Arena stadında 2011-2012 sezonu açılış maçında karşı karşıya gelmiş ve maçtan 1-0 mağlup ayrılmıştır.
2016- 2017 sezonunda TFF 1. Ligden düşerek 2. Lige geçti.[4] 2019-20 sezonunda sezona -15 puanla başlayan takım Covid-19 salgını sonrası tamamlanmadan tescillenen ligde daha önce düşmesi kesinleştiği için 2. Ligden 3. Lige düştü.[5] Fakat daha sonra TFF Liglerde 2019-2020 sezonu için küme düşmeyi kaldırarak tekrar 2. Ligde kalmıştır.
Türkiye Kupası'nda
Şanlıurfaspor 2006-2007 sezonunda 2. Lig A kategorisi için düzenlenen yükselme grubuna çıkmak ve 2007-2008 yılı Türkiye Kupası'nda 2. Lig A kategorisi takımı Malatyaspor'u 6-0 ve devamında Süper Lig takımı Konyaspor'u 2-1 yenerek gruplara kalmıştır. Gruplarda ise Kayserispor, Gaziantepspor ve Alanyaspor ile eşleşen sarı yeşilliler ilk maçında Alanyaspor'u 3-0 yenmiş, Kayserispor ve Gaziantepspor ile de 1-1 berabere kalmıştır. 16 Ocak 2008 tarihinde Grubu'ndaki son maçında Fenerbahçe ile Kadıköy'de Fenerbahçe Şükrü Saracoğlu Stadyumu'nda oynamış ve 1-0 öne geçtiği maçtan 3-2 mağlup ayrılmıştır. Bu sonuçlardan gruplarda 3. olarak elenmiştir.[6]
Şanlıurfaspor 2012-13 sezonunda Türkiye Kupası 4. tur maçında Trabzonspor ile karşı karşıya geldi. Hüseyin Avni Aker Stadyumu'nda oynanan mücadelede Şanlıurfaspor, Trabzonspor'a 4-0 mağlup olarak kupadan elenmiştir.[7]
Şanlıurfaspor 2022-23 Türkiye Kupası'nda, 2. turda, 3. Lig'den Karşıyaka takımını deplasmanda 4-2 mağlup ederek 3. tura yükseldi. 3. turda deplasmanda yine 3. Lig takımı Karaman FK deplasmanında rakibine karşı 3-0 galip gelerek 4. tura yükseldi. Bu turda ise 1. Lig takımı Denizlispor takımınına karşı deplasmanda 5-0 gibi farklı bir galibiyet elde ederek 5. tura yükseldi. Bu turda Süper Lig ekiplerinden Beşiktaş ile eşleşti.[8] 22 Aralık 2022 tarihinde İstanbul'da, Vodafone Park stadyumunda oynanan maçta Beşiktaş karşısında ilk yarıyı 2-0 önde kapatan Şanlıurfaspor, ikinci yarıda üst üste yediği gollerle maçtan 4-2 lik mağlubiyet ile ayrılıp kupadan elendi.[9]
Diğer branşlar
Kulüp erkek basketbol takımı ile Bölgesel Basketbol Liginde ve 3. Lig'de mücadele etmiştir.[a] 2014 yılından bu yana ise faaliyet göstermemektedir.
Not: Uyruk bilgisi futbolcuların FIFA uygunluk kurallarınca oynayabileceği millî takımı gösterir. FIFA kuralları haricinde başkaca uyruğa da sahip olabilirler.
Şanlıurfaspor'un maçlarının oynadığı Şanlıurfa Gap Arena Stadyumu, 2009
26 bin 400 m² toplam alan üzerine inşa edilmiş tam olimpik stadyum
13 bin 600 m² tribün alanı üzerine yayılmış, tamamının üstü kapalı, 30 bin koltuk kapasitesi
Çatı üzerine monte edilmiş modern ışıklandırma sistemi
UEFA standartlarında soyunma odaları, koridor boşlukları, temsilci ve hakem odaları
Futbol branşında kullanılmak üzere 4 adet; atletizm branşlarında kullanılmak üzere 18 adet soyunma odası
3 adet kondisyon salonu, 16 adet antrenman salonu, 1 adet 4 kulvarlı 60 metrelik atletizm pistine sahip salon
2000 kişi kapasiteli şeref tribünü
Teknolojik altyapıya sahip basın tribünü
Paratoner ve engelli tribünü
250 kişi kapasiteli basın toplantı salonu ile çok amaçlı basın çalışma salonları
Güvenlik kontrol odası ile TV ve radyo yorumcuları için özel oda
Turnikelerin düzenlenmesi ile seyircilerin acil bir durumda sahaya çıkmasını sağlayacak merdiven ve kapılar
Naklen yayın ve basın odaları, toplantı salonları
20.814 m² alana yayılmış 5.500 araçlık otopark
Ayrıca stadyumun ışıklandırmasının yetersiz oluşundan dolayı 2012-2013 sezonunda ışıklandırma sistemi için stadyumun etrafına 4 adet ışıklandırma direği dikilmiş ve Şanlıurfaspor'un gece maçları oynamaktadır.
