Amonyak içinde azot, oktet sayısını tamamlamak üzere 5 değerlik elektrona ve kendisine bağlı üç hidrojen atomuna sahiptir. Bu normalde her bir bağ açısı cos-1(-1/3) ≈ 109.5 ° olan dörtyüzlü geometri ile sonuçlanacaktır. Fakat, üç hidrojen atomu, elektronun yalın çifti tarafından, geometrinin 107°'lik bir açıyla bir üçgen piramit (normal 3-yüzlü piramit) ile bükülecek şekilde itilir. Bunun aksine, boron triflorürüçgen düzlemsel geometriye sahiptir çünkü borda amonyakta olduğu gibi atomların itilmesine sebep olacak elektron yalın çifti bulunmaz. Amonyakta trigonal piramit hızlı azot tersinimine uğrar.[1]
Amonyağın elektron çifti düzenlemesi dört yüzlüdür: iki yalın elektron sarı renkte, hidrojen atomları beyaz renkte gösterilir.
Moleküler geometri, amonyakın üçgen piramidal geometriye sahip olduğunu gösteren elektron çifti düzenlemesinden çıkarılabilir.