Thewissen, 1993'ten 1999'a kadar Kuzeydoğu Ohio Tıp Üniversitesi'nde (daha sonra Northeastern Ohio Üniversiteleri Tıp Fakültesi olarak adlandırıldı) yardımcı doçent, ardından 1999'dan 2008'e kadar doçent oldu.
2001 yılında Tokyo Teknoloji Enstitüsü'nde misafir profesör olarak bulundu. 1994'ten beri Cleveland Doğa Tarihi Müzesi'nde araştırma görevlisidir. 2008'de Kuzeydoğu Ohio Tıp Üniversitesi'nde Anatomi Profesörü olan Ingalls-Brown Bağışlı Kürsüsü oldu.[2] Şubat 2019'da Alaska'daki Sitka Sound Science Center'da ikamet eden bir bilim insanıydı.
2014. JGM Thewissen. Sekiz Milyon Yılda Karadan Suya Yürüyen Balinalar. California Press Üniversitesi, 245 s. Yürüyen Balinalar 28 Temmuz 2017 tarihinde Wayback Machine sitesinde arşivlendi.