Foyston anslöt till Djurgården i augusti 2013 som assisterande tränare till Per Mathias Högmo i Djurgården. Högmo blev under hösten 2013 klar som ny förbundskapten för Norges herrlandslag i fotboll, men tog inte med sig Foyston på heltid. Den 27 november2013 förlängde Foyston kontraktet med DIF (2 år). I början av augusti 2014 – strax efter VM-slutspelet i Brasilien och inför EM-kvalet – lämnade Foyston Djurgården för att jobba som assisterande tränare till Högmo på heltid.[2][3]
Han ingick tidigare i staben för Fulham FC. Där analyserade Foyston matcherna och hade ansvar för individuell utveckling.
Efter tre år med landslaget lämnade han för att gå med i Strømsgodset IF i Norge och arbetade där med huvudtränare, Tor Ole Skullerud. Undertecknade ett tvåårskontrakt som assisterande tränare.
Den 6 december 2018 skrev Martin Foyston på ett tvåårskontrakt med Hammarby IF U19. Under 2020 blev han uppflyttad till Hammarbys U23-lag.
I december 2023 presenterades Foyston som ny tränare för Superettan-laget Östers IF med ett kontrakt på 2+1 år.[1]
