Estbröte omtalas i Erikskrönikan i samband med händelserna år 1206; när Jon Jarls hustru hämnades sin makes död på deras gård Asknäs då hon hann ikapp estniska sjörövare som hade slagit läger på ön.
Ön hör till Ekebyhovs slott som sedan år 1980 ägs av Ekerö kommun. Den siste privata ägaren försökte stycka loss ön som en enskild tomt i början av 1970-talet, men denna ansökan tillbakavisades. Förutom fyren på öns östra spets är ön inte elektrifierad. Ön bebyggdes 1926.
Estbröte fornborg
Estbröte fornborg ligger på krönet av en brant bergsrygg. Fornborgen är 230 x 170 meter stor. I väster, där berget är mindre brant, finns en stenmur med skarpkantiga stenar och är mellan 25 och 30 meter lång, omkring fem meter bred och mellan 0,3 och 0,5 meter hög. I muren finns två skyttevärn som är omkring 2,5 meter i diameter och mellan 0,5 och 0,7 meter djupa. En bit från dessa rester finns rester av flera yttre murar. På en bergsavsats i närheten finns fem terrasser, som troligen är husgrunder.
Vy över Estbröte från söder över Vårbyfjärden. Längst till vänster syns Gällstaö i Ekerö kommun, och till höger Johannesdal i Stockholms kommun, januari 2013.