Clark Art Institude skapades av entreprenören och konstsamlaren Robert Sterling Clark och hans fru Francine. Robert Sterling Clark hade efter ett äventyrligt liv i Fjärran Östern slagit sig ned i Paris 1911 och använde sig av en betydande ärvd förmögenhet, vilken kom från Singerkoncernen), för att samla konst. Hans fru biträdde med inköpen, efter det att de gift sig 1919.
Paret överenskom med Williams College om att donera samlingen till ett nybyggt museum i Williamstown. En stiftelse bildades 1950 och museet öppnade 1955. Museibyggnaden ritades av Daniel Deverell Perry (1905-2002). I juli 2014 utökades museet med Stone Hill Center, som ritats av Tadao Ando, på en närbelägen skogbeklädd kulle, med utställningsutrymmen och en konservatorsverkstad.
Samlingar
Paret Clark samlade i början framför allt italienska, holländska och flamländska målningar. Senare började de samla på yngre konst som verk av John Singer Sargent, Edgar Degas, Winslow Homer och Pierre-Auguste Renoir. Efter 1920 intresserade de sig främst för franskt 1800-tal och särskilt impressionister och Barbizonskolan.
Från 1955 har Clark Art Institute främst samlat fotografier.