Омеје је своју професионалну каријеру започео у француском клубу Селестат када је 1994. потписао први професионални уговор. У Селестату је играо све до 2000. када је прешао у Монпеље. За Монпеље је играо у два наврата (2000−2006 и 2013−2014) са којим је по 5 пута освајао Француско првенство и куп Француске, 4 пута лига куп, док је 2003. године освојио и ЕХФ Лигу шампиона. Врхунац каријере доживио је у Килу за којег је играо од 2006. до 2014. са којим је освојио по 6 пута првенство и куп Немачке, 4 суперкупа, 3 ЕХФ Лиге шампиона, 1 суперкуп Европе и 1 трофеј светског клупског првенства. 2014. је прешао у амбициозни Париз Сен Жермен са којим је освојио 5 пута Француско првенство, 2 пута куп Француске и по 3 пута суперкуп и лига куп Француске. Каријеру је завршио 2019. године у дресу Париз Сен Жермена у својој 42 години.
