Формира се на ушћу река Брајтах, Стилах и Третах, у близини Оберстдорфа, у алпском региону Алгој. Одатле тече према северу, пролазећи поред градова Зонтхофен, Именштат им Алгој и Кемптен .
Између Лаутраха код Мемингена и Улма формира границу између две немачке покрајине, Баварске и Баден-Виртемберга, дужине од око 50 km. Река се улива у Дунав у центру града Улма.
Илер има сливно подручје од 2.152 km2 (831 sq mi). Она је седма река Баварске по протоку воде, са просечним протоком од 75 m3/s (2.600 cu ft/s) у Зендену. Снага реке користи се за производњу хидроелектричне енергије путем осам електрана укупне нето снаге 51 МВ (1998).
