Prefektura Samos (gr:Νομός Σάμος - Nomos Samos) je oblast u periferiji Severni Egej na krajnjem istokuGrčke. Ona obuhvata dva značajna ostrva, veće i istoimeno Samos i manje Ikarija, kao i nekoliko manjih ostrva u blizini (od njih značajno je ostrvlje Furni). Upravno središte i najvažnije mesto prefekture je grad Vati na Samosu.
Prirodne odlike
Prefektura Samos je jedna od ostrvskih prefektura Grčke. Najveći deo prefekture (oko 95% površine) čine dva značajna ostrva - Samos i Ikarija. Oba ostrva pripadaju sevenoj grupi Egejskih ostrva. Ostrva su planinska.
Klima u celoj prefekturi je u primorskim delovima sredozemna sa toplim i dugim letima i blagim i kišovitim zimama. Na većim visinama u unutrašnjosti ostrva ona ima nešto oštriju varijantu.
Stanovništvo
Glavno stanovništvo prefekture Samos su Grci. OKo 75% stanivništva živi na Samosu, a 20% na Ikariji.