Od 1966, sedište eparhije nalazi se u Zagrebu, gde je i grkokatolički seminar, koji je izgrađen 1681. godine.
Godine 1990, Križevačka eparhija brojala je širom sveta oko 50.000 vernika i 52 parohije. Danas ima oko 21.500 vernika u 32 parohije, od njih oko 15.600 u Hrvatskoj u 22 parohije. Razlog za opadanje broja vernika jeste asimilacija u rimokatolike, ali i izdvajanje grkokatoličkih egzarhata u Srbiji i Crnoj Gori i u Makedoniji.
Grkokatolike u Hrvatskoj danas čine oko 7.830 Rusina, 6.294 Hrvata i 2.295 Ukrajinaca. U Sloveniji broje se oko 1.298 vernika križevačke eparhije, u Bosni i Hercegovini oko 4.776 vernika.