Михаил Балинский родился 14 августа 1794 года в Тересполе в семье Анны (урождённой) Корсак и Игнатия Ивановича Балинского, будущего статского советника и Виленского уездного маршала (предводителя дворянства). Учился в Виленском университете, где в 1815 году получил степень магистра философии на естественно-математическом факультете.
В 1816—1822 и 1820—1830 годах сотрудник журнала «Dziennik Wileński». Вместе с историком, профессором Виленского университета Иоахимом Лелевелем основал журнал «Tygodnik Wileński» (1818). Был членом общества шубравцев («бездельников»), где носил имя Аушлавис, и сотрудник сатирического издания шубравцев „Wiadomości Brukowe“.
Масон, член виленской ложи «Усердный литвин реформированный», созданной членами общества шубравцев.
В мае 1819 года унаследовал отцовское имение в Яшунах (25 км от Вильнюса).
В мае 1820 года женился на Зофии Снядецкой, дочери президента общества шубравцев, профессора Виленского университета Анджея Снядецкого и племяннице ректора университета Яна Снядецкого. Ян Снядецкий, выйдя в отставку (1824), обосновался у зятя в Яшунах, где для семьи Снядецких-Балинских был выстроен дворец в стиле позднего классицизма по проекту Кароля Подчашинского. Здесь часто и подолгу бывали Томаш Зан, А. Э. Одынец, Юлиуш Словацкий и многие другие представители виленской интеллектуальной элиты.
За причастность к подготовке восстания 1831 года Балинский находился под арестом.
С 1836 года жил в Варшаве. Стал одним из основателей научного и литературного журнала «Biblioteka Warszawska». С 1847 года жил главным образом в Яшунах, часто бывая в Вильне. Со дня основания (1855) состоял вице-председателем Виленской археологической комиссии. В 1859 году также был вице-председателем Музеума древностей в Вильно. Написал трёхтомную историю Вильны (1836—1837) и труд по истории виленской иезуитской Академии и университета (1862). Член Минералогического общества в Дрездене, Научного общества в Кракове, Русского географического общества.
Mykolas Balinskis. Vilniaus miesto istorija. Iš lenkų kalbos vertė Ona Slavėnaitė, Irena Katilienė; iš lotynų kalbos vertė Jūratė BaronienėVilnius: Mintis, 2007. ISBN 978-5-417-00907-5 (первый перевод на литовский язык).
Серков А. И. Русское масонство. 1731—2000 гг. Энциклопедический словарь. — М.: Российская политическая энциклопедия, 2001. — 1224 с. — 3 000 экз. — ISBN 5-8243-0240-5.