Nonstop-деградация

Nonstop-деградация. В отсутствие стоп-кодона рибосома «зависает» на мРНК; её высвобождение может происходить при участии белка Ski7 или без него[1]

Nonstop-деграда́ция[2] (англ. Non-stop decay) — механизм контроля качества мРНК, направленный на выявление мРНК, лишённых стоп-кодона, и предотвращение их трансляции. В ходе nonstop-деградации рибосома, которая успела значительно продвинуться в сторону 3'-конца мРНК, диссоциирует, и мРНК направляется в экзосомный комплекс (у эукариот) или к РНКазе R[англ.] (у бактерий) для дальнейшего разрушения[3][4].

В 2016 году было показано, что nonstop-деградация имеет противовирусную активность при заражении вирусом гепатита B. У одного из транскриптов этого вируса (X-мРНК) в 3'-конце есть старт-кодон, расположенный после основного стоп-кодона. При трансляции этого транскрипта рибосома связывается и с 3'-концевым старт-кодоном, но «зависает» из-за отсутствия стоп-кодона. Из-за этого Х-мРНК распознаётся системой nonstop-деградации и разрушается экзосомой[5].

Механизм

мРНК, не имеющие стоп-кодона, могут появиться в результате преждевременного 3'-полиаденилирования, при котором сигналы полиаденилирования находятся в кодирующей области транскрипта[6]. Рибосома, связывающаяся с такими мРНК, осуществляет их трансляцию, пока на она не дойдёт до поли(А)-хвоста, на котором «зависает», и не может диссоциировать от мРНК[7]. Если не избавляться от мРНК без стоп-кодонов, то многие рибосомы будут неспособны транслировать нормальные мРНК, будучи связанными с дефектными транскриптами. Nonstop-деградация высвобождает «зависшие» рибосомы и отправляет мРНК без стоп-кодона на деградацию нуклеазами. Nonstop-деградация протекает по двум основным механизмам, которые, вероятно, действуют совместно[8][9].

Путь Ski7

Белок Ski7, как предполагается, имеет домен для связывания с пустым А-сайтом рибосомы и тем самым помогает «зависшим» рибосомам освободиться от транскрипта без стоп-кодона. Другой домен Ski7 взаимодействует с экзосомой[10]. После диссоциации рибосомы Ski7 остаётся связанным с дефектным транскриптом, и именно в таком виде транскрипт разрушается цитозольными экзосомами. Комплекс экзосомы с Ski7 быстро деаденилирует мРНК, и далее экзосома разрушает транскрипт в направлении от 3'-конца к 5'-концу[8][9].

Путь, независимый от Ski7

Стадии транс-трансляции от A до F. Рибосома с сайтами связывания тРНК (E, P и A) застряла возле 3'-конца разорванной мРНК. тмРНК связывается с А-сайтом, позволяя рибосоме сменить матрицу для трансляции с поврежденной мРНК на тмРНК (первый считываемый в тмРНК кодон — GCA, показан синим). После этого трансляция продолжается. При достижении стоп-кодона в тмРНК (красный UAA) гибридный белок с меткой для протеолиза (зелёные шарики) освобождается

Второй путь NSD был впервые описан у дрожжей. В отсутствие Ski7 поли(А)-связывающие белки (PABP) диссоциируют от поли(А)-хвоста. Из-за диссоциации белков PABP с транскрипта удаляется защитный 5'-концевой кэп, и транскрипт быстро разрушается эндогенными экзонуклеазами, например, XrnI, направлении от 5'-конца к 3'-концу[9]. В клетках млекопитающих отсутствует Ski7, и в nonstop-деградации участвует белок Hbs1 из того же семейства, белок Dom34, с которым связывается Hbs1, и компоненты комплекса экзосомы/Ski: Ski2/Mtr4 и Dis3[англ.]. Hbs1-Dom34 связывается с экзосомой/Ski, формируя мультибелковый комплекс. Кроме того, для удаления белков, синтезированных с транскриптов без стоп-кодона, необходим белок листерин[англ.], содержащий RING-домен[англ.][11].

У бактерий

У бактерий для высвобождения зависшей рибосомы имеется особый механизм транс-трансляции. Ключевые молекулы, участвующие в этом процессе — особая транспортно-матричная РНК (тмРНК) и белок SmpB. тмРНК связывается с А-сайтом «зависшей» рибосомы, причём на конце участка, взаимодействующего с рибосомой, присоединена аминокислота аланин. Неподалёку от неё с тмРНК связан SmpB. Рибосома начинает транслировать тмРНК, при этом к полипептиду, синтезированному с дефектного транскрипта, прикрепляется особая аминокислотная последовательность (она считывается с тмРНК), которая направляет полипептид на деградацию. Рибосома, закончившая трансляцию тмРНК, диссоциирует и освобождается[4].

Примечания

  1. ↑ Garneau N. L., Wilusz J., Wilusz C. J. The highways and byways of mRNA decay. (англ.) // Nature Reviews. Molecular Cell Biology. — 2007. — February (vol. 8, no. 2). — P. 113—126. — doi:10.1038/nrm2104. — PMID 17245413. [исправить]
  2. ↑ Кребс Дж., Голдштейн Э., Килпатрик С. Гены по Льюину. — М.: Лаборатория знаний, 2017. — С. 618. — 919 с. — ISBN 978-5-906828-24-8.
  3. ↑ Vasudevan S., Peltz S. W., Wilusz C. J. Non-stop decay--a new mRNA surveillance pathway. (англ.) // BioEssays : News And Reviews In Molecular, Cellular And Developmental Biology. — 2002. — September (vol. 24, no. 9). — P. 785—788. — doi:10.1002/bies.10153. — PMID 12210514. [исправить]
  4. ↑ 1 2 Venkataraman K., Guja K. E., Garcia-Diaz M., Karzai A. W. Non-stop mRNA decay: a special attribute of trans-translation mediated ribosome rescue. (англ.) // Frontiers In Microbiology. — 2014. — Vol. 5. — P. 93—93. — doi:10.3389/fmicb.2014.00093. — PMID 24653719. [исправить]
  5. ↑ Aly H. H., Suzuki J., Watashi K., Chayama K., Hoshino S., Hijikata M., Kato T., Wakita T. RNA Exosome Complex Regulates Stability of the Hepatitis B Virus X-mRNA Transcript in a Non-stop-mediated (NSD) RNA Quality Control Mechanism. (англ.) // The Journal Of Biological Chemistry. — 2016. — 29 July (vol. 291, no. 31). — P. 15958—15974. — doi:10.1074/jbc.M116.724641. — PMID 27281821. [исправить]
  6. ↑ Temperley R. J. Investigation of a pathogenic mtDNA microdeletion reveals a translation-dependent deadenylation decay pathway in human mitochondria (англ.) // Human Molecular Genetics. — 2003. — 15 July (vol. 12, no. 18). — P. 2341—2348. — ISSN 1460-2083. — doi:10.1093/hmg/ddg238. [исправить]
  7. ↑ Karzai A. W., Roche E. D., Sauer R. T. The SsrA-SmpB system for protein tagging, directed degradation and ribosome rescue. (англ.) // Nature Structural Biology. — 2000. — June (vol. 7, no. 6). — P. 449—455. — doi:10.1038/75843. — PMID 10881189. [исправить]
  8. ↑ 1 2 van Hoof A., Frischmeyer P. A., Dietz H. C., Parker R. Exosome-mediated recognition and degradation of mRNAs lacking a termination codon. (англ.) // Science (New York, N.Y.). — 2002. — 22 March (vol. 295, no. 5563). — P. 2262—2264. — doi:10.1126/science.1067272. — PMID 11910110. [исправить]
  9. ↑ 1 2 3 Frischmeyer P. A. An mRNA Surveillance Mechanism That Eliminates Transcripts Lacking Termination Codons (англ.) // Science. — 2002. — 22 March (vol. 295, no. 5563). — P. 2258—2261. — ISSN 0036-8075. — doi:10.1126/science.1067338. [исправить]
  10. ↑ Миронова Л. Н., Падкина М. В., Самбук Е. В. РНК: синтез и функции. — СПб.: Эко-вектор, 2017. — С. 272. — 287 с. — ISBN 978-5-906648-29-7.
  11. ↑ Saito S., Hosoda N., Hoshino S. The Hbs1-Dom34 protein complex functions in non-stop mRNA decay in mammalian cells. (англ.) // The Journal Of Biological Chemistry. — 2013. — 14 June (vol. 288, no. 24). — P. 17832—17843. — doi:10.1074/jbc.M112.448977. — PMID 23667253. [исправить]

Read other articles:

Arneson River Theater

The Arneson River Theater routinely features local acts that draw large crowds throughout the year. Arneson River Theater seating Arneson River Theater is an outdoor performance theater located on the San Antonio River Walk in the U.S. state of Texas. The open-air venue was erected 1939-1941 by the Works Progress Administration. The design was supervised by architect Robert H.H. Hugman. It is named after Edwin P. Arneson, the regional engineer for the W.P.A. who was instrumental in securing f...

 

Gus Bilirakis

American politician & lawyer (born 1963) Bilirakis redirects here. For his father, the politician, see Michael Bilirakis. For the poker player, see Steve Billirakis. Gus BilirakisOfficial portrait, 2023Member of theU.S. House of Representativesfrom FloridaIncumbentAssumed office January 3, 2007Preceded byMichael BilirakisConstituency9th district (2007–2013)12th district (2013–present)Member of the Florida House of Representativesfrom the 48th districtIn officeNovember ...

 

G.K. Chesterton

GKC beralih ke halaman ini. Untuk kegunaan lain, lihat GKC (disambiguasi). G. K. ChestertonG. K. Chesterton, foto dari E. H. Mills, 1909.LahirGilbert Keith Chesterton(1874-05-29)29 Mei 1874Kensington, London, InggrisMeninggal14 Juni 1936(1936-06-14) (umur 62)Beaconsfield, Buckinghamshire, InggrisMakamPemakaman Katolik Roma, BeaconsfieldPekerjaanJurnalis, novelis, esaisBahasaInggrisKewarganegaraanInggrisPendidikanSt Paul's School (London)AlmamaterSlade School of ArtPeriode1900–1936Genre...

Pangkat bintang enam

Sketsa lambang tanda pangkat bintang enam, berdasarkan rancangan dalam file Angkatan Darat AS. Pangkat bintang enam adalah pangkat jenderal bintang enam. Untuk di Angkatan Bersenjata Amerika Serikat dinamakan General of the Armies (GAS) dalam Angkatan Darat Amerika Serikat dan Admiral of the Navy (AN) untuk Angkatan Laut Amerika Serikat, yang diusulkan oleh Senat Amerika Serikat. Pangkat militer ini merupakan yang tertinggi di Amerika Serikat sampai saat ini, satu tingkat di atas Jenderal Bes...

 

Associazione Calcio Siena 1967-1968

Questa voce sull'argomento stagioni delle società calcistiche italiane è solo un abbozzo. Contribuisci a migliorarla secondo le convenzioni di Wikipedia. Segui i suggerimenti del progetto di riferimento. Voce principale: Associazione Calcio Siena. AC SienaStagione 1967-1968Sport calcio Squadra Siena Allenatore Natale Faccenda Presidente Bixio Gianfaldoni Serie C6º nel girone B Maggiori presenzeCampionato: Vezzani (38) Miglior marcatoreCampionato: Tonoli (11) StadioDel Rastrello ...

 

Jack W. Szostak

Jack W. SzostakLahir(1952-11-09)9 November 1952London, InggrisTempat tinggalUSKebangsaanAmerika SerikatAlmamaterMcGill University, Cornell UniversityPenghargaanPemenang Hadiah Nobel dalam bidang fisiologi atau kedokteran (2009)Karier ilmiahBidangBiologiInstitusiHarvard Medical School, Howard Hughes Medical Institute Jack W. Szostak (lahir 9 November 1952) adalah seorang ahli biologi dan profesor genetika dari Harvard Medical School yang mendapat hadiah Nobel untuk bidang Fisiologi atau Kedok...

Great Lakes Airlines

For other airlines, see Great Lakes Airlines (Canada) and Great Lakes Air. Great Lakes Airlines IATA ICAO Callsign ZK GLA LAKES AIR Founded1977Ceased operationsMarch 26, 2018AOC #GLBA031AHubs Denver[1] Los Angeles Phoenix–Sky Harbor[1] Fleet size28Destinations10[1]Parent companyGreat Lakes Aviation, Ltd.Traded asExpert Market: GLUXHeadquartersCheyenne, Wyoming, United StatesFoundersDoug VossIvan Simpson The former logo of the company A Great Lakes Beec...

 

Johannes Ludwig Chrisostomus Abineno

Pdt. Prof. Dr.Johannes Ludwig Chrisostomus AbinenoLahir( 1917-12-07)7 Desember 1917Baun, TimorMeninggal22 Januari 1995(1995-01-22) (umur 77)KebangsaanIndonesiaSuami/istriAlberta Anthonia MeijerOrang tuaTobias Abineno (bapak)Carolina Koroh (ibu) J. L. Ch. Abineno (07 Desember 1917 – 22 Januari 1995) adalah seorang Pendeta dari Gereja Masehi Injili di Timor kelahiran Baun yang pernah menjabat sebagai Dosen di Sekolah Tinggi Teologi Jakarta.[1][2] Riwayat Hi...

 

MobileStar

First logo of MobileStar Network, Inc. MobileStar Network was a wireless Internet service provider which first gained notability in deploying Wi-Fi Internet access points in Starbucks coffee shops, American Airlines Admiral Club locations across the United States and at Hilton Hotels. Founded by Mark Goode and Greg Jackson in 1998, MobileStar was the first wireless ISP to place a WiFi hotspot in an airport, a hotel, or a coffee shop. MobileStar's core value proposition was to provide wireless...

Winnie l'ourson

Winnie l'ourson Illustration d'Ernest Howard Shepard (1926). Entourage Tigrou Porcinet Jean-Christophe Petit Gourou Coco Lapin Bourriquet Maître Hibou Lumpy Voix Sterling Holloway (1966-1977) ; Hal Smith (1981-1986) ; Jim Cummings (depuis 1989) Roger Carel (1967-2011) ; Jean-Claude Donda (depuis 2011, voix chantée depuis 2000) Pierre Lacasse (1999-2011) ; Pierre Verville (depuis 2011) Séries Les Aventures de Winnie l'ourson, Les Nouvelles Aventures de Winnie l'ourson, ...

 

Romanización (aculturación)

Este artículo o sección necesita referencias que aparezcan en una publicación acreditada. Busca fuentes: «Romanización (aculturación)» – noticias · libros · académico · imágenesEste aviso fue puesto el 28 de agosto de 2017. Expansión del dominio romano:      República romana      Imperio romano      Imperio romano de occidente      Imperio romano de oriente &...

 

新罕布什尔州

坐标：43°11′38″N 71°34′21″W / 43.1938516°N 71.5723953°W / 43.1938516; -71.5723953 此條目需要补充更多来源。 (2017年5月21日)请协助補充多方面可靠来源以改善这篇条目，无法查证的内容可能會因為异议提出而被移除。致使用者：请搜索一下条目的标题（来源搜索：新罕布什尔州 — 网页、新闻、书籍、学术、图像），以检查网络上是否存在该主题的更多可靠来源...

世界政區索引

此條目可能包含不适用或被曲解的引用资料，部分内容的准确性无法被证實。 (2023年1月5日)请协助校核其中的错误以改善这篇条目。详情请参见条目的讨论页。 各国相关 主題列表 索引 国内生产总值 石油储量 国防预算 武装部队（军事） 官方语言 人口統計 人口密度 生育率 出生率 死亡率 自杀率 谋杀率 失业率 储蓄率 识字率 出口额 进口额 煤产量 发电量 监禁率 死刑 国债 ...

 

Laut Aral

Peta Laut Aral. Laut Aral (bahasa Kazakh: Арал теңізі Aral teñizi; bahasa Uzbek: Orol Dengizi; bahasa Rusia: Аральскοе мοре Aral'skoye more; bahasa Tajik: баҳри Арал bahri Aral; Persia: دریاچه خوارزم Daryocha-i Khorazm) adalah danau yang terletak di Asia Tengah. Danau ini diapit oleh Kazakhstan (Provinsi Aktobe dan Kyzylorda) di utara dan Uzbekistan (Karakalpakstan) di selatan. Nama danau ini secara kasar dapat diterjemahkan menjadi...

 

Regional rail

Inter-urban passenger train with frequent stops This article is about non-commuter regional rail. For commuter and suburban railways, see commuter rail. For the former British Rail division, see Regional Railways. For the system in Philadelphia, see SEPTA Regional Rail. For the short-line railroad operator, see Regional Rail, LLC. This article possibly contains original research. Please improve it by verifying the claims made and adding inline citations. Statements consisting only of original...

Snake River Desperadoes

1951 film by Fred F. Sears Snake River DesperadoesTheatrical release posterDirected byFred F. SearsWritten byBarry ShipmanProduced byColbert ClarkStarringCharles StarrettDon ReynoldsTommy IvoMonte BlueSmiley BurnetteCinematographyFayte M. BrowneEdited byPaul BorofskyProductioncompanyColumbia PicturesDistributed byColumbia PicturesRelease date May 30, 1951 (1951-05-30) Running time54 minutesCountryUnited StatesLanguageEnglish Snake River Desperadoes is a 1951 American Western fi...

 

Sophie Lellouche

Pour les articles homonymes, voir Lellouche. Cet article est une ébauche concernant une réalisatrice française. Vous pouvez partager vos connaissances en l’améliorant (comment ?) selon les conventions filmographiques. Pour plus d’informations, voyez le projet Cinéma. Sophie Lellouche Données clés Nationalité Française Profession Réalisatrice modifier Sophie Lellouche, au centre, avec Patrick Bruel et Alice Taglioni au festival du film de Cabourg 2012. Sophie Lellouche est ...

 

سباق طواف فرنسا 2019

سباق طواف فرنسا 2019 تفاصيل السباقسلسلة106. طواف فرنسامنافسةطواف العالم للدراجات 2019 2.UWT‏مراحل21التواريخ06 – 28 يوليو 2019المسافات3٬365٫8 كمالبلدان فرنسا بلجيكانقطة البدايةمدينة بروكسلنقطة النهايةباريسالفرق22عدد المتسابقين في البداية176عدد المتسابقين في النهاية155متوسط السرعة4...

Chengdu J-20

Questa voce sull'argomento aerei è solo un abbozzo. Contribuisci a migliorarla secondo le convenzioni di Wikipedia. Segui i suggerimenti del progetto di riferimento. Chengdu J-20 Mighty DragonUn J-20 durante il Zhuhai Airshow 2016.DescrizioneTipocaccia multiruolo stealth Equipaggio1 pilota Costruttore CAC Data primo volo11 gennaio 2011[1][2] Data entrata in servizio10 marzo 2017[3][4] Utilizzatore principale PLAAF Esemplari208 (2022)[5][6]...

 

Mercenary

Soldier who fights for hire For other uses, see Mercenary (disambiguation). Hired Gun redirects here. For other uses, see Hired Gun (disambiguation). Leonardo da Vinci's Profilo di capitano antico, also known as il Condottiero, 1480. Condottiero meant contractor in its more literal sense but came to be applied to leaders of mercenary groups in Italy during the Late Middle Ages and the Renaissance. A mercenary, also called a merc, soldier of fortune, or hired gun, is a private individual who j...