Родился в 1601 году в Антверпене в семье Франса Эйкенса-Старшего и Йоханны Нис, и был крещён 17 апреля 1601 года в церкви Святой Вальбурги в том же городе. Дядей Франса являлся художник Осиас Берт, один из основоположников фламандской школы натюрморта, к обучению у которого он приступил в возрасте 14 лет. Другим его учителем был исторический живописец Лукас Флоке-Старший.
В 1631 году, в возрасте примерно 30 лет, Эйкенс вступил в антверпенскую гильдию Святого Луки в качестве самостоятельного художника (мастера). В 1635 году он женился на художнице Катарине Флоке, дочери его учителя Лукаса. Три её брата также являлись художниками.
В 1665 году Эйкенс окончательно перебрался из Антверпена в Брюссель, чтобы быть поближе к штатгальтерскому двору.
Скончался в 1693 году в Брюсселе.
Творчество
Эйкенс специализировался на написании натюрмортов с цветами и фруктами, однако, он также писал натюрморты с битой дичью и рыбой. Он нередко сотрудничал с другими художниками того времени, в частности, с Якобом Йордансом, а возможно и с Рубенсом, отвечая за изображение цветов на их полотнах.
Эйкенс также создавал картины, представлявшие собой религиозные или иные изображения в обрамлении цветочных гирлянд или венков, так называемые «натюрморты-гирлянды» — жанр, популярный во Фландрии XVII столетия. При этом изображение в центре венка нередко выполнялось другим художником.
Эйкенс как правило подписывал свои работы, что упрощает их идентификацию.