Профессионально начал заниматься футболом в 15 лет в воронежском «Факеле». До этого тренировался в местной секции. В школу московского «Спартака» поступил со второго раза. На момент поступления являлся восьмиклассником. Дебютировал за «Спартак» 7 июля 2004 года в матче против «Кубани», когда Невио Скала стал привлекать в основной состав молодых игроков, однако после того, как в команду перешли Неманья Видич и Клементе Родригес, потерял место в основном составе. Эта игра осталась единственной для Шишкина в сезоне. Отыграв два сезона за дубль, принял решение об уходе из клуба, но Владимир Федотов, который был назначен спортивным директором клуба, уговорил его остаться. Вскоре Федотов стал главным тренером «Спартака» и ввёл Шишкина в основной состав — на правый край защиты, в то время как Радослав Ковач стал полузащитником, а Мартин Йиранек, бывший до этого правым защитником, занял место Ковача в центре обороны. Отыграв несколько матчей, Шишкин получил множество лестных отзывов, вследствие чего Гус Хиддинк пригласил его участвовать в тренировочном процессе национальной сборной.[источник не указан 2830 дней] С приходом в «Спартак» ещё одного защитника, Антонио Жедера, Шишкин не потерял места в основе. 1 октября 2006 года забил свой первый гол за основной состав «Спартака» в матче против «Москвы» (3:3). 12 сентября 2006 года дебютировал в Лиге чемпионов, выйдя на замену вместо Йиранека в матче с мюнхенской «Баварией».
Закончился 2008-й, меня вызвали в клуб. Слышу от Карпина: «Ты даже в 18 не проходишь». Такого поворота никак не ожидал. Всё-таки спартаковский воспитанник, мечтал играть в этой команде. Я был готов пахать и не боялся конкуренции. Но мне было сказано — езжай в аренду, здесь ловить нечего. Пришлось уехать в Самару. В следующем сезоне все сборы прошёл со «Спартаком». Выглядел неплохо, никаких претензий от тренеров. Тут «Амкар» зовёт в аренду, и Карпин снова возвращается к теме: «Лучше ехать. Ты же не хочешь на лавке сидеть?» Я понимал, что это будет очередная ссылка, из которой, при всём уважении к «Амкару», вернуться в футбольную элиту будет гораздо сложнее. Уходить не стал и правильно сделал — летом пригласили в «Локомотив». Конфликтов у нас не было. Мне Карпин сказал, что считает Паршивлюка более сильным игроком. Хорошо, это право тренера. Но когда Паршивлюк сломался, в обороне выходил Саенко, который вообще не защитник. А я за первый круг ни в основе, ни в дубле не играл. Бывало, приезжаю в Тарасовку, мне говорят: «Сегодня работаешь отдельно от команды. С тренером по физподготовке Оскаром Гарсия»[5].
«Локомотив»
6 июля 2010 года перешёл в московский «Локомотив», подписав контракт до конца сезона с возможностью продления ещё на 3 года[6][7]. Сумма трансфера составила 500 тысяч долларов[8]. Уход из «Спартака», где Шишкин перестал попадать в состав[9], произошёл не по его инициативе[10][11]. Первый матч за «Локомотив» в рамках чемпионата России провёл 7 августа 2010 года в Самаре против «Крыльев Советов» (0:0). Главный тренер «Локомотива» Юрий Сёмин остался удовлетворён игрой Шишкина: «На мой взгляд, он сыграл достаточно прилично, действовал уверенно»[12]. Почти ровно за год до этого матча, 9 августа 2009 года, Шишкин сыграл за «Крылья Советов» в домашнем матче чемпионата России против «Локомотива» и открыл счёт в матче, забив гол в свои ворота. Тот матч «Крылья» проиграли — 1:3[13]. Позже Николай Наумов, президент «Локомотива» в 2007—2010 годах, в последние месяцы руководства которого «Локомотив» и приобрёл Шишкина, шутил на эту тему: «Он уже тогда выступал за нас»[14].
С 2016 года
В сезоне 2016/17 редко выходил на поле в первой части чемпионата, не имея поддержки Сёмина, и 28 января 2017 года перешёл в «Краснодар» на правах аренды до 30 июня 2017 года[15]. 3 июля 2017 года разорвал контракт с «Локомотивом» и на правах свободного агента перешёл в «Краснодар», подписав трёхлетнее соглашение[16].
13 января 2019 года перешёл в «Крылья Советов» на правах аренды до конца сезона 2018/19.
Летом 2019 года подписал однолетний контракт с клубом ФНЛ «Торпедо» Москва. 17 февраля 2020 года расторг контракт по соглашению сторон[17].
19 февраля 2020 года по приглашению тренера «Спартака-2» Романа Пилипчука подписал контракт до конца сезона 2019/20, чтобы помочь клубу не вылететь из ФНЛ[18][19]. 26 мая стало известно, что «Спартак» не будет продлевать контракт[20].
24 марта 2007 года дебютировал в составе сборной России в отборочном матче чемпионата Европы-2008 с командой Эстонии (2:0). В ноябре 2010 года попал в расширенный список кандидатов в сборную на матч с Бельгией[23], а потом был вызван в расположение сборной. Отыграл весь матч. В 2012 году попал в предварительный состав сборной на Евро-2012. Во время сборов у футболиста начались проблемы с желудком, вследствие чего 24 мая 2012 он покинул расположение сборной и был госпитализирован в гастроэнторологическое отделение одной из московских клиник. Шишкин пропустил чемпионат Европы. В октябре 2015 года был вызван в сборную для участия в отборочных матчах чемпионата Европы 2016 против сборных Молдавии и Черногории, но на поле не выходил.
Жена Арина. 15 ноября 2022 года родился сын Ярослав. От первого брака две дочери: Маргарита (родилась 19 марта 2012 года) и Марианна (родилась 21 января 2016 года).
↑[sport24.ru/news/football/2020-05-26-spartak-ne-budet-prodlevat-kontrakty-s-shishkinym-i-dyakovym-oni-pokinut-klub-31-maya «Спартак» не будет продлевать контракты с Шишкиным и Дьяковым, они покинут клуб 31 мая] (неопр.). Дата обращения: 26 мая 2020. Архивировано 6 июля 2020 года.
Некоторые внешние ссылки в этой статье ведут на сайты, занесённые в спам-лист
Эти сайты могут нарушать авторские права, быть признаны неавторитетными источниками или по другим причинам быть запрещены в Википедии. Редакторам следует заменить такие ссылки ссылками на соответствующие правилам сайты или библиографическими ссылками на печатные источники либо удалить их (возможно, вместе с подтверждаемым ими содержимым).