Исток реки находится на западе горной системы Малый Хинган. Сначала река течёт вдоль гор на север, а затем поворачивает на запад, огибая с севера городской уезд Бэйань городского округа Хэйхэ. Потом река течёт через городской уезд Удаляньчи, и на территории городского уезда Нэхэ городского округа Цицикар впадает в Нэньцзян.
Топонимика
По реке Нэмэр назван городской уезд Нэхэ, на территории которого река впадает в Нэньцзян.