В 1796 году согласился принести верноподданническую присягу российскому императору Павлу I. За это он был освобождён вместе с 12 тысячами пленных поляков.
С 1813 член Временного совета, управляющего Варшавским герцогством. Министр юстиции Царства Польского.
В 1815 годуАлександр I оценил верность бывшего генерала повстанцев Т. Вавжецкого и назначил его министром юстиции Королевства Польского, наградив также пожизненным титулом сенатора-воеводы.
Могила Вавжецкого находится в посёлке Видзы, Браславский район, Витебская область, Белоруссия. На плите рядом с фамильным гербом надпись: «Товарищ и сподвижник Т. Костюшки, участник и руководитель восстания 1794 года».
В деревне Видзы-Ловчинские в настоящее время находится усадьба Вавжецких конца XVIII века, которую строил Томаш Вавжецкий. Вокруг дома сохранился двухсотлетний парк[2].
↑Tomo Vavžeckio epitafija(лит.). Vilniaus Šv. vysk. Stanislovo ir šv. Vladislovo arkikatedra bazilika. Vilniaus katedra, Katalikų interneto tarnyba (2010—2017). Дата обращения: 14 ноября 2017. Архивировано 17 ноября 2017 года.