Впервые нанесена на карту под современным названием в XIX веке. Гидроним произошёл от хантыйскогоёхан — «река»[3].
Согласно верованиям местных ненцев и хантов, название связано с богиней Агана — великой женщиной, покровительницы обитателей реки[3].
Истоки Агана расположены на возвышенном болотистом водоразделе бассейна реки Пур и правых притоков Оби, в озере Менсавэмтор[4][5] на высоте 78 м над уровнем моря[6]. Протекает в центральной части Западно-Сибирской равнины. В среднем и нижнем течении река образует широкую (до 4,5 км, в приустьевом участке до 8 км) сегментно-гривистую двухстороннюю пойму с многочисленными изогнутыми старичными озёрами, протоками, берега которых поросли хвойными деревьями и березняком[3]. Правобережная часть бассейна вдвое больше левобережной[3]. Высота устья — 33 м над уровнем моря[7].
Преимущественно снеговое и дождевое питание. Среднегодовой расход в районе посёлка Аган (87 км от устья) — 274,65 м³/с[8]. Ледостав — с конца ноября по май[9]. Половодье с мая по июль, с резким подъёмом уровней и затяжным спадом. Осенью как правило дождевые паводки[3]. Объём стока — 8,679 км³/год, половина которого приходится на половодье[3].
По Агану производится сплав леса. Река судоходна от устья до Радужного (335 км); по ней завозятся грузы во внутренние районы Ханты-Мансийского АО. Максимальная продолжительность навигации составляет около 140 суток[3].
На реке развито спортивная и туристическая рыбалка, при этом промышленный лов рыбы не производится[3].
В водах реки обитают стерлядь, нельма, налим, язь, окунь, щука[3].
По данным водного реестра России, относится к Верхнеобскому бассейновому округу. Речной бассейн — (Верхняя) Обь до впадения Иртыша, речной подбассейн — Обь ниже Ваха до впадения Иртыша, водохозяйственный участок — Обь от впадения р. Вах до г. Нефтеюганска[1].
Средний расход воды (м³/с) реки Аган по месяцам с 1960 по 1987 гг. (замеры производились на гидрологическом посту в районе посёлка Агана в 87 км от устья)[8]
↑Ресурсы поверхностных вод СССР: Гидрологическая изученность. Т. 15. Алтай и Западная Сибирь. Вып. 2. Средняя Обь / под ред. В. В. Зееберг. — Л.: Гидрометеоиздат, 1967. — 351 с.
↑ 123456789101112Сурков В. В.Аган(рус.). — статья из научно-популярной энциклопедии «Вода России». Дата обращения: 13 апреля 2017.
↑Лист карты P-44-XIII,XIV. Масштаб: 1 : 200 000. Состояние местности на 1979 год. Издание 1986 г.
↑Перевалова Е. В., Карачаров К. Г.Река Аган и её обитатели (рус.). — Екатеринбург; Нижневартовск: УрО РАН; Студия «ГРАФО», 2006. — С. 6. — 352 с.