Em meados do século XIX, pequenas choupanas foram surgindo na região e, mais tarde, formaram um povoado denominado Bebedouro, atualmente município. Um dos mais antigos moradores do lugar, capitão José Modesto de Abreu, doou uma gleba de terras situada na Serra dos Dourados, onde o capitão José Sijus ergueu o primeiro rancho.
Uma capela foi construída e a partir de 1880 algumas famílias foram-se fixando ao seu redor, formando a povoação de São João Batista dos Dourados, cujo nome homenageia o Santo padroeiro e identifica a localização do povoado.
Passada uma década, as duas povoações vizinhas, São João dos Dourados e Bebedouro, reivindicavam a elevação à categoria de Distrito de Paz, tendo alcançado melhor êxito, em 1891, a de São João Batista dos Dourados.
Geografia
Localiza-se a uma latitude 22º06'00" sul e a uma longitude 48º19'03" oeste, estando a uma altitude de 706 metros. Sua população estimada em 2006 era de 9.244 habitantes.
No município fica o centro geométrico do estado de São Paulo, centro de São Paulo, com a seguinte latitude e longitude (-22.070647,-48.4337&spn=0.018096,0.042658 = 22º04'11,17"S, 48º26'00,52"O)
No setor de telefonia a cidade era atendida pela Telecomunicações de São Paulo (Telesp), que inaugurou a central telefônica utilizada até os dias atuais. Em 1998 esta empresa foi vendida para a Telefônica, que em 2012 adotou a marca Vivo para suas operações[8].