Arouca iniciou a sua carreira jogando nas categorias de base do Fluminense, quando tinha onze anos, onde permaneceu até aos dezessete. Conquistou vários títulos[1] e acabou sendo convocado diversas vezes para as Seleções Brasileiras de base.[2] Foi efetivado na equipe principal em 2003, onde permaneceu até 2008, onde fez um trabalho considerado bom.
Em 2007 foi campeão da Copa do Brasil[5] com o Fluminense, e o clube carioca ainda em quarto lugar no Campeonato Brasileiro.[6] No ano seguinte, fez parte da campanha tricolor que alcançou o vice-campeonato da Libertadores, após a derrota para a LDU nos pênaltis.[7]
Em setembro de 2008, completou 200 partidas com a camisa do Fluminense.[8]
Em 2009, acertou sua transferência para o São Paulo[9], ficando assim no banco de reservas, mas mesmo assim disputou mais uma Copa Libertadores.[10] Como no time paulista o jogador estava descontente na reserva, os dirigentes do São Paulo aceitaram realizar um empréstimo para o Santos por um ano, em uma troca com Rodrigo Souto.
Santos
2010
Em 2010, foi campeão paulista pelo Santos. O jogador caiu nas graças da torcida quando, no jogo da final contra o Santo André, Arouca salvou um gol em cima da linha. Naquele momento da partida o Santos tinha dois jogadores a menos e perdia por 3 a 2. Ao final do campeonato, ele foi eleito pela FPF o melhor volante da Competição.[11] Posteriormente, viria a ser importante na conquista da Copa do Brasil pelo Peixe.
Em julho teve seu passe comprado em definitivo, assinando com o time da Vila Belmiro até agosto de 2014. O Peixe pagou R$ 8 milhões ao São Paulo e a empresa que detinha 50% dos direitos sobre o jogador. Agora, o Alvinegro passou a ter direito a 90% dos recursos que serão adquiridos numa futura negociação. Os outros 10% são do próprio jogador.
No início de 2011, Arouca ficou fora do time por vários jogos devido a contusões musculares. Retornou ao time titular em uma das partidas mais decisivas do ano, contra o Cerro Porteño no Paraguai, jogo em que o Santos precisava da vitória para seguir com chances de classificação para a fase de mata-mata na Taça Libertadores da América. O jogo terminou 2 a 1 para o Peixe, com grande atuação da equipe.
Mesmo sendo um dos jogadores mais decisivos do Santos, Arouca nunca havia marcado um gol pela equipe. Seu primeiro gol com a camisa do Peixe, aconteceu logo na final do Paulistão contra o Corinthians. O Santos ganhou o jogo por 2 a 1 sagrando-se bicampeão paulista 2010-11. Este gol teve um detalhe curioso, Arouca relatou ter tido um sonho em que marcaria seu primeiro gol como jogador do Santos justo nessa final, o que de fato ocorreu. Além do gol ainda teve bela atuação, jogando bola até na trave.
Com grandes atuações em partidas decisivas, em pouco tempo Arouca tornou-se unanimidade entre os torcedores do Santos. Em uma pesquisa feita pela empresa de consultoria e marketing Sport+Mark, Arouca apareceu entre os jogadores em atividade mais queridos pelos torcedores santistas, superando ídolos como Elano e Léo.[15]
2012
Na temporada em que comemora o seu centenário, a equipe do Santos iniciou o Paulistão sob pressão por bons resultados, pois o time vinha de uma derrota marcante contra o Barcelona na final do Mundial de Clubes. O grupo soube corresponder em campo, conseguindo conquistar o Paulistão e tendo como principais destaques Neymar, Ganso e o próprio Arouca, que fez seu segundo gol com a camisa alvinegra em partida contra o Guarani. Tais atuações renderam ao jogador diversos elogios, aumentando a pressão sobre o treinador da Seleção Brasileira, Mano Menezes, para a convocação do volante.
Em entrevista ao Globo Esporte, Arouca disse estar passando a melhor fase de sua carreira, tendo como principal objetivo estar na Copa do Mundo de 2014.[16]
Ao final da temporada, Arouca fez um balanço positivo de 2012, dizendo que, além das conquistas coletivas do tricampeonato paulista, há muito inédito, e da Recopa Sul-Americana com o clube, ter também chegado à Seleção Brasileira "foi um sonho realizado e [que quer] continuar no grupo."[17]
Palmeiras
Em janeiro de 2015, Arouca entrou com uma ação judicial contra o Santos por conta de salários e direitos de imagem atrasados. Após sua ação ser negada pela justiça duas vezes, Arouca entrou em acordo com o Santos para rescindir seu contrato assim o santos ficou com 40% de seus direitos,ja o palmeiras ficou com ,60%. Em 30 de janeiro de 2015, assinou com o Palmeiras por quatro temporadas.[18][19]
Após ser vice-campeão paulista pelo Palmeiras, Arouca foi eleito o pela FPF um dos melhores volantes da competição, sendo também incluso na seleção do campeonato.
Se sagrou campeão da Copa do Brasil de 2015, vencendo na final o seu ex-time, o Santos, por 2 A 1 (dois gols de Dudu). O Palmeiras venceu nos pênaltis por 4 a 3, com grande atuação de Fernando Prass.
Em 2016, mesmo com poucas partidas jogadas por conta de uma lesão, sagrou-se eneacampeão brasileiro com o Palmeiras.
Atlético Mineiro
Em 14 de dezembro de 2017, foi anunciado como novo jogador do Atlético Mineiro, assinando por empréstimo de uma temporada.[20] Foi liberado pelo clube em julho de 2018, tendo disputado apenas 12 partidas.[21]
Vitória
No dia 11 de julho de 2018, o Vitória confirmou sua contratação por empréstimo até o fim do ano.[22]
Figueirense
Foi anunciado como reforço do Figueirense no dia 12 de janeiro de 2020.[23]
Seleção Brasileira
Um dos grandes momentos da carreira do jogador veio no dia 23 de agosto de 2012, quando Arouca foi convocado pela primeira vez para servir a categoria principal da Seleção Brasileira.[24]
Na reestreia do técnico Felipão, em fevereiro de 2013, contra a Inglaterra, no Estádio de Wembley, Arouca entrou no segundo tempo e errou um passe em um recuo; o atacante Wayne Rooney se antecipou e tocou para Frank Lampard, que, num golaço, mandou para o fundo da rede.
Na convocação seguinte da Amarelinha, para os amistosos diante de italianos e russos, em março de 2013, Arouca acabou de fora da lista. Ao volante, na dúvida de ter sido preterido por causa de sua falha no jogo anterior ou não: “Claro que queria estar na convocação, mas não vou abaixar a cabeça por causa disso (não ter sido lembrado). Pelo contrário, já que isso serve de motivação para mim. É algo que me faz continuar trabalhando forte e me dedicando, para ter novas oportunidades no futuro”. A forte motivação, por sua vez, vem do fato de Arouca ter sido presença constante nas últimas listas de Mano Menezes antes de deixar o cargo e na estreia de Luiz Felipe Scolari na Seleção.[25]